RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeastyeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSD1YGL196W YOR304C-AO14468 76 aa2.92□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W PRE1P22141 198 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W LHP1P33399 275 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W PAM17P36147 197 aa2.92□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W CSH1P38287 376 aa2.92□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W APQ12P40532 138 aa2.92□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W VPS28Q02767 242 aa2.92□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W SWC7Q06707 132 aa2.92□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W LDB18Q07887 179 aa2.92□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W MED11Q99278 115 aa2.92□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W STP22P25604 385 aa2.91□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W HYM1P32464 399 aa2.91□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W DLS1P40366 167 aa2.91□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W SBH1P52870 82 aa2.91□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W GPI11Q06636 219 aa2.91□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W FYV12Q08559 129 aa2.91□□□□□ -1.94
DSD1YGL196W YCR099CP25657 155 aa2.9□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W RRT1P38192 103 aa2.9□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W HHO1P53551 258 aa2.9□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W DAD4P69851 72 aa2.9□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W SPC3Q12133 184 aa2.9□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W MHF1Q3E835 90 aa2.9□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W HAP2P06774 265 aa2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W SEC59P20048 519 aa2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YBR220CP38318 560 aa2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W GLC8P41818 229 aa2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YGR201CP42936 225 aa2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W AIM36Q03798 255 aa2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W HRD1Q08109 551 aa2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YOR015WQ12169 119 aa2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YHR086W-AQ3E746 53 aa2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W MHF2Q3E829 80 aa2.89□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W RAD6P06104 172 aa2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YFR010W-AP0C5N0 62 aa2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W PEX34P25584 144 aa2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YPT31P38555 223 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W RPS12P48589 143 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W HHT1P61830 136 aa2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W DYN2Q02647 92 aa2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W RNH202Q05635 350 aa2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W FRQ1Q06389 190 aa2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YPR013CQ12145 317 aa2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W ATP14Q12349 124 aa2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W MOT1P32333 1867 aa2.88□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W ATP5P09457 212 aa2.87□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W SRB6P32570 121 aa2.87□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W IPT1P38954 527 aa2.87□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W MET31Q03081 177 aa2.87□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W PST2Q12335 198 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa2.87□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W RPL30P14120 105 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W FUN14P18411 198 aa2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W SSS1P35179 80 aa2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W UPS2P35200 230 aa2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W SFK1P35735 353 aa2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YPL073CP40323 161 aa2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W NSE4P43124 402 aa2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W SNN1P48232 102 aa2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W TVP18Q04767 167 aa2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W SYM1Q06563 197 aa2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YOR381W-AQ3E804 55 aa2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W RIB3Q99258 208 aa2.86□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W SPS2P08459 502 aa2.85□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.85□□□□□ -1.95not detected
DSD1YGL196W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W THG1P53215 237 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W RAV2Q03956 351 aa2.85□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W SCP1Q08873 200 aa2.85□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W PCC1Q3E833 88 aa2.85□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W COX5BP00425 151 aa2.84□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W HAP3P13434 144 aa2.84□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YEL073CP39974 107 aa2.84□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W IGO1P53897 168 aa2.84□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W SDH7Q04401 133 aa2.84□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YHR007C-AQ07074 71 aa2.84□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W ATG10Q07879 167 aa2.84□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YOL131WQ08270 108 aa2.84□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YLR361C-AQ3E795 98 aa2.84□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W YLR099W-AQ3E798 87 aa2.84□□□□□ -1.95
DSD1YGL196W MDM35O60200 86 aa2.83□□□□□ -1.96
DSD1YGL196W PRS3P38689 320 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
DSD1YGL196W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
DSD1YGL196W SWM2P40342 146 aa2.83□□□□□ -1.96
DSD1YGL196W MPM1P40364 252 aa2.83□□□□□ -1.96
DSD1YGL196W YDR366CP87287 132 aa2.83□□□□□ -1.96
DSD1YGL196W YDR391CQ04170 232 aa2.83□□□□□ -1.96
DSD1YGL196W YPR114WQ06107 315 aa2.83□□□□□ -1.96
DSD1YGL196W CNL1Q06333 122 aa2.83□□□□□ -1.96
DSD1YGL196W YIR021W-AQ3E739 70 aa2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58 ms