RNA–Protein interactions for RNA: YDL057W

YDL057W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YDL057W, Length 987 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YDL057W	YDL057W	YNL046W	P53956	172 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YDL057W	YDL057W	CSI2	Q08054	341 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YDL057W	YDL057W	RKI1	Q12189	258 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YDL057W	YDL057W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YDL057W	YDL057W	FZF1	P32805	299 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	ECM14	P38836	430 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	PAU7	P39545	55 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
YDL057W	YDL057W	YIR020C	P40575	100 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	CIN5	P40917	295 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	COX16	P47081	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	PAU23	Q07987	124 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	PAU17	Q12370	124 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YCR007C	P25354	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	TIR2	P33890	251 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	RRT1	P38192	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	HAC1	P41546	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YFR045W	P43617	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	HST4	P53688	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	DAD4	P69851	72 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	CWC27	Q02770	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	IRC25	Q07951	179 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	AYT1	Q12226	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	STF1	P01098	86 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	NCA3	P46955	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	MIX17	Q03667	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	TVP18	Q04767	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	RXT3	Q07458	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	DAD1	Q12248	94 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	JID1	Q12350	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	HTB2	P02294	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	CYC3	P06182	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	MDM10	P18409	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	VMA16	P23968	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	MIG1	P27705	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	IES6	P32617	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YKR045C	P36138	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YGL230C	P53074	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YGR151C	P53287	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	MSC3	Q05812	728 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	SEC11	P15367	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	UTR5	P32630	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	GPI18	P38211	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YJL163C	P46996	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	GTO3	Q04806	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	ATG33	Q06485	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	ATO3	Q12359	275 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	MBB1	P39534	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YJL213W	P40896	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YPI1	P43587	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	BRP1	P53194	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YNL234W	P53857	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YDR366C	P87287	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	UPS3	Q04006	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	DPP1	Q05521	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	TIM18	Q08749	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YPS1	P32329	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	YMR141C	P40211	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	SNA4	Q07549	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YDL057W	YDL057W	PHO85	P17157	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YDL057W	YDL057W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YDL057W	YDL057W	IMP2	P46972	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YDL057W	YDL057W	MIC26	P50087	233 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YDL057W	YDL057W	YGR017W	P53210	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YDL057W	YDL057W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YDL057W	YDL057W	UBC7	Q02159	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YDL057W	YDL057W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YDL057W	YDL057W	FCY1	Q12178	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YDL057W	YDL057W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YDL057W	YDL057W	IRC23	Q08416	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YDL057W	YDL057W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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