RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LPPQ93052 612 aa23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX25Q9H3E2 840 aa23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMACRQ9UHK6 382 aa23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHF24Q9UPV7 400 aa23.08■■□□□ 1.29
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA8SH3BPF8 625 aa23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CKBP12277 381 aa23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPHB4P54760 987 aa23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EMBQ6PCB8 327 aa23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC30AQ86WT1 665 aa23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEC14L1Q92503 715 aa23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USTQ9Y2C2 406 aa23.07■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASP8Q14790 479 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PGBD4Q96DM1 585 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HINFPQ9BQA5 517 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIOSQ9NXC5 875 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HESX1Q9UBX0 185 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCYOX1Q9UHG3 505 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 F8VP50 259 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPL9P32969 192 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CUL1Q13616 776 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JOSD2Q8TAC2 188 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNIP3Q96KP6 325 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAM2Q99965 735 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC4A5Q9BY07 1137 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VIPAS39Q9H9C1 493 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSAD1Q9HA92 442 aa23.06■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLA2G4AP47712 749 aa23.05■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX16P57768 344 aa23.05■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HTRA3P83110 453 aa23.05■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACAP1Q15027 740 aa23.05■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLNQ7Z5Q5 900 aa23.05■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM110Q86TL2 294 aa23.05■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAVIN3Q969G5 261 aa23.05■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM187AA6NFU0 413 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 E5RJQ4 531 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARVCFO00192 962 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYB561D2O14569 222 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GABRDO14764 452 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTI1O43156 1089 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RARAP10276 462 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMA2P25787 234 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMO2P25791 158 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CARSP49589 748 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCNN1GP51170 649 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DR1Q01658 176 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NNTQ13423 1086 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC19Q9H756 370 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYLDQ9NQC7 956 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ST7Q9NRC1 585 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ESYT3A0FGR9 886 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KBTBD13C9JR72 458 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PODXLO00592 558 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INPPL1O15357 1258 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDGFRBP09619 1106 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FNTAP49354 379 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCAT1P54687 386 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PMF1Q6P1K2 205 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM17Q9Y577 477 aa23.04■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HCRTO43612 131 aa23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPL34P49207 117 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLCNKBP51801 687 aa23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BST2Q10589 180 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSTM1Q86WC4 334 aa23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM86AQ8N2M4 240 aa23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB17Q9H0T7 212 aa23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms