RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C DER1P38307 211 aa0.56□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C GLC8P41818 229 aa0.56□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C FMP49A0A023PZB3 126 aa0.55□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C BUB2P26448 306 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YBR027CP38220 110 aa0.55□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C FMN1Q03778 218 aa0.55□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C NMA1Q06178 401 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C VAM10Q08474 114 aa0.55□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YCR001WP25347 104 aa0.54□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C TMA23Q03525 211 aa0.54□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C UBR1P19812 1950 aa0.54□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YGL041W-AP0C5N3 154 aa0.54□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C IPT1P38954 527 aa0.54□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YER181CP40097 107 aa0.54□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C RCF2P53721 224 aa0.54□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C RFU1Q08003 200 aa0.54□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C SRP21P32342 167 aa0.53□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C ECM31P38122 312 aa0.53□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YJL218WP40892 196 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C YPD1Q07688 167 aa0.53□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C IRC19Q07843 230 aa0.53□□□□□ -2.32
HDA3YPR179C PHO13P19881 312 aa0.52□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C HYP2P23301 157 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C FIG1P38224 298 aa0.52□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C RRT7Q07829 113 aa0.52□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C DDR48P18899 430 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data0.51□□□□□ -2.33not detected
HDA3YPR179C YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C ATP19P81451 68 aa0.5□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C SMD2Q06217 110 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C YPR153WQ06537 140 aa0.5□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C PET20Q99373 253 aa0.5□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C SED1Q01589 338 aa0.5□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C GPI11Q06636 219 aa0.5□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C SCS22Q6Q595 175 aa0.5□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C HSL1P34244 1518 aa0.49□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C HHY1P39982 102 aa0.49□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C GPI2P46961 280 aa0.49□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C EST3Q03096 181 aa0.49□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C RIB3Q99258 208 aa0.49□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C HAP2P06774 265 aa0.48□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C NHP6AP11632 93 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C SEN15Q04675 128 aa0.48□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C YHR213W-BQ8TGK1 99 aa0.48□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C PRP8P33334 2413 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C COX5BP00425 151 aa0.48□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C RPL33AP05744 107 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C HSP12P22943 109 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C MGR2Q02889 113 aa0.48□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C YOR072WQ08486 104 aa0.48□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C ARC19P33204 171 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C VMA10P48836 114 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C RAV2Q03956 351 aa0.47□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
HDA3YPR179C PET54P10834 293 aa0.46□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C IPI1P38803 334 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C DIE2P50076 525 aa0.46□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C PKR1Q03880 122 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YGL014C-AP0C5N1 53 aa0.46□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C FYV5P25585 152 aa0.46□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YCL001W-AP87012 153 aa0.46□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C MHF1Q3E835 90 aa0.46□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C RPS1BP23248 255 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YGR201CP42936 225 aa0.45□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C MOG1P47123 218 aa0.45□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C HUT1Q12520 339 aa0.45□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YOR1P53049 1477 aa0.45□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C SRL3P36167 246 aa0.45□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YMR122CQ03879 124 aa0.45□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C IRC21Q04772 201 aa0.45□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YMR320WQ04897 101 aa0.45□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C SOM1Q05676 74 aa0.45□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C PHB1P40961 287 aa0.44□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YJL009WP47078 108 aa0.44□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C SUI1P32911 108 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YMR141CP40211 102 aa0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C LST8P41318 303 aa0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C LSM1P47017 172 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YNL019CP53975 284 aa0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C DDP1Q99321 188 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C LAA1P39526 2014 aa0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C EFM5P53200 248 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YDR366CP87287 132 aa0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C RAF1Q06891 181 aa0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YOR385WQ08909 290 aa0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C PRM3Q08931 133 aa0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C GSC2P40989 1895 aa0.43□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C NMT1P14743 455 aa0.42□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C QCR6P00127 147 aa0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YHR213WP0CI67 198 aa0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C YHR140WP38842 239 aa0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C LSM8P47093 109 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C SPG1P50088 95 aa0.41□□□□□ -2.34
HDA3YPR179C COA4Q05809 96 aa0.41□□□□□ -2.34
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