RNA–Protein interactions for RNA: YOR069W

VPS5, Transcript of Nexin-1 homolog, yeast

Gene VPS5, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VPS5	YOR069W	RAV2	Q03956	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	YHP1	Q04116	353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	SOR2	Q07786	357 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	REC104	P33323	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	DOG2	P38773	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	PCP1	P53259	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	YNL184C	P53876	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	CDC43	P18898	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	UBC13	P52490	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	API2	Q04413	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	UPS1	Q05776	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS5	YOR069W	VPS63	O13549	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	FZF1	P32805	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	TIM18	Q08749	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	ECM14	P38836	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YIL086C	P40503	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	REE1	P40893	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YJL163C	P46996	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	TOM7	P53507	60 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	HSK3	P69852	69 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	ELC1	Q03071	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	IRC25	Q07951	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	AYT1	Q12226	474 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YMR31	P19955	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	DAL80	P26343	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YPT10	P38146	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	BLM10	P43583	2143 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YPI1	P43587	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YJR096W	P47137	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	SWS2	P53937	143 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	SNA4	Q07549	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	FIT2	Q08906	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	CYC3	P06182	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	SFT2	P38166	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	ICS2	P38284	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YFR045W	P43617	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	PGU1	P47180	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	RAF1	Q06891	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	PRM3	Q08931	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	MDM10	P18409	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YKL069W	P36088	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	PAU7	P39545	55 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	HPF1	Q05164	967 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	ATG33	Q06485	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	INO4	P13902	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YPS1	P32329	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	HEM4	P06174	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	APS1	P35181	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YKL044W	P36092	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	SDC1	Q03323	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	DUT1	P33317	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YKL097C	P34245	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	ATX1	P38636	73 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	SNF11	P38956	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YNL092W	P53934	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YCR023C	P25351	611 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	FPR2	P32472	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	CMC1	P36064	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	MST28	P39552	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	EGT2	P42835	1041 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	ATG21	Q02887	496 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	MIX17	Q03667	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	GTO3	Q04806	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	MRX11	Q03079	207 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	MIX14	Q04341	121 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	WSC3	Q12215	556 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VPS5	YOR069W	OST2	P46964	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	CPT1	P17898	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YCR006C	P25350	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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