RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	PEP8	P40335	379 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VBA1	YMR088C	EAF6	P47128	113 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VBA1	YMR088C	DSK2	P48510	373 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VBA1	YMR088C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VBA1	YMR088C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
VBA1	YMR088C	RNH203	Q12338	110 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VBA1	YMR088C	MAK32	P23060	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YGL262W	P53054	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	TOS8	P53147	276 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	CNE1	P27825	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	MPM1	P40364	252 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	SUN4	P53616	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	ROT1	Q03691	256 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	GAT3	Q07928	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	DAD1	Q12248	94 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	COX19	Q3E731	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	TIM9	O74700	87 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	MTC7	P32633	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	SDH3	P33421	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	NRG2	P38082	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	CTF8	P38877	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	FIP1	P45976	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	RPB7	P34087	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	SMP1	P38128	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	SFT2	P38166	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YIA6	P40556	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	SLG1	P54867	378 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	PET191	Q02772	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	IRC25	Q07951	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	TIM18	Q08749	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YCR099C	P25657	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
VBA1	YMR088C	SHE1	P38200	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	GPI18	P38211	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	UMP1	P38293	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YBR292C	P38357	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	ECM34	P38728	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YER181C	P40097	107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	MIC27	P50945	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	MSA1	Q08471	629 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	ATG41	Q12048	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	MOT1	P32333	1867 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	MRS4	P23500	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	TOM6	P33448	61 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	SVP26	P38869	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	PHS1	P40857	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	TDA4	P47153	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	SDS23	P53172	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	MST27	P53176	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	MSB2	P32334	1306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	PEX2	P32800	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	CSH1	P38287	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	HSP10	P38910	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	GAT4	P40569	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YNL234W	P53857	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	TSC3	Q3E790	80 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	SEC11	P15367	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	UBC4	P15731	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	APS1	P35181	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	PEX17	P40155	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	MHF2	Q3E829	80 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VBA1	YMR088C	AHT1	P29589	182 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	CSE2	P33308	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YJL028W	P47062	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	ASM4	Q05166	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	ATO3	Q12359	275 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	HEM2	P05373	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	MCH4	Q08268	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
VBA1	YMR088C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VBA1	YMR088C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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