RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	CCH1	P50077	2039 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	VAR1	P02381	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	WSC4	P38739	605 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YFL065C	P43539	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YPS5	P53057	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YML079W	Q03629	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	SDH7	Q04401	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	TIM18	Q08749	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	PRM3	Q08931	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	PEX11	Q12462	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	AGA2	P32781	87 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YER076C	P40049	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	ATO3	Q12359	275 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	SPS100	P13130	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	GPX1	P36014	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	ATX1	P38636	73 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	SUR7	P54003	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	MCT1	Q12283	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	COA2	Q3E823	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	STE7	P06784	515 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	INO2	P26798	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	DPP1	Q05521	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	FCY2	P17064	533 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	PCL1	P24867	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	AHT1	P29589	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	ECM34	P38728	170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	OXA1	P39952	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	RIM9	Q04734	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	LIP2	Q06005	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YCR025C	P25352	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YKR041W	P36134	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	AZF1	P41696	914 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	CTA1	P15202	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	PAM17	P36147	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	SWS2	P53937	143 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	CRZ1	P53968	678 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	AIM34	Q03673	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBX2	YML013W	MDH2	P22133	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	MST28	P39552	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	GPI2	P46961	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	OST2	P46964	130 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YOR062C	P36025	268 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	MOH1	P38191	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	XBP1	P40489	647 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YJL213W	P40896	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	MIC27	P50945	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	ATG40	Q99325	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	MRS1	P07266	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YKR073C	P36153	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	MTC6	P38849	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YIL029C	P40538	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YNL234W	P53857	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	LPP1	Q04396	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	RFM1	Q12192	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	COX10	P21592	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	ECM14	P38836	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	TIM17	P39515	158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YNR064C	P53750	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	MSB2	P32334	1306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YGL118C	P53132	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	PIR3	Q03180	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	JID1	Q12350	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	TOS8	P53147	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBX2	YML013W	CRH1	P53301	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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