RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	RXT3	Q07458	294 aa		6.67	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	YOR352W	Q08816	343 aa		6.67	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	AYT1	Q12226	474 aa		6.67	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	TIR1	P10863	254 aa		6.67	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	CUP2	P15315	225 aa		6.67	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	YBR090C	P38253	122 aa		6.67	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	CSI2	Q08054	341 aa		6.67	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	FCY1	Q12178	158 aa		6.67	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	SPO24	Q3E752	67 aa		6.67	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	PAM17	P36147	197 aa		6.66	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	YPT10	P38146	199 aa		6.66	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	PRE3	P38624	215 aa		6.66	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	BNA1	P47096	177 aa		6.66	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	GIM5	Q04493	163 aa		6.66	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	ATX2	Q12067	313 aa		6.66	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	TIR2	P33890	251 aa		6.65	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	MIX23	P38162	196 aa		6.65	□□□□□ -1.34
GGA2	YHR108W	DDI2	P0CH63	225 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	DDI3	P0CH64	225 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YIR020C	P40575	100 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YHR213W	P0CI67	198 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	FUN14	P18411	198 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	MRPL44	P19956	98 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	HUA1	P40325	198 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YNL092W	P53934	400 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	SCM4	P32564	187 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YIL012W	P40551	113 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	COX18	P53239	316 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YPS1	P32329	569 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YIL077C	P40508	320 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	ABM1	P47146	123 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	IZH1	Q03419	316 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YMR166C	Q03829	368 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	TRI1	Q05024	226 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	FZF1	P32805	299 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YFR045W	P43617	309 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	RPA43	P46669	326 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	TDA4	P47153	279 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	DUG3	P53871	357 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	IRC23	Q08416	157 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	DAD1	Q12248	94 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	HTB2	P02294	131 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	AME1	P38313	324 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	MBB1	P39534	108 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	DAD4	P69851	72 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	UBC7	Q02159	165 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	TMA10	Q06177	86 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	POM33	Q12164	279 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	FYV7	Q12247	151 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	PAU7	P39545	55 aa		6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	IMP2	P46972	177 aa		6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	ZRT1	P32804	376 aa		6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	VMA11	P32842	164 aa		6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YER134C	P40081	178 aa		6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	YGL118C	P53132	145 aa		6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	SDS23	P53172	527 aa		6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	TIM18	Q08749	192 aa		6.59	□□□□□ -1.35
GGA2	YHR108W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	CSM4	Q08955	156 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	CYC3	P06182	269 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	YDR215C	Q12240	137 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	YKL102C	P34249	101 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	POR2	P40478	281 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	ATG33	Q06485	197 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	TRA1	P38811	3744 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	PAU16	P35994	123 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	GLE2	P40066	365 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	YMR141C	P40211	102 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	YMR317W	Q04893	1140 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	ERS1	P17261	260 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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