RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, human

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DSE	Q9UL01	958 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.27	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MYH11	P35749	1972 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612		H0Y858	1186 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CLDN5	O00501	218 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZNF197	O14709	1029 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HUS1	O60921	280 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ECI2	O75521	394 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BEST1	O76090	585 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NOL4	O94818	638 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TNNC2	P02585	160 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MYL1	P05976	194 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	AOC1	P19801	751 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BDNF	P23560	247 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GABRR2	P28476	465 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PNPLA4	P41247	253 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SOX9	P48436	509 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LHX1	P48742	406 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NLRP12	P59046	1061 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ORC1	Q13415	861 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ADAM9	Q13443	819 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NCOA4	Q13772	614 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GAS6	Q14393	721 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GRM2	Q14416	872 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BECN1	Q14457	450 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SURF1	Q15526	300 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZACN	Q401N2	412 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TATDN2	Q93075	761 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.26	□□□□□ -1.73

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