RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP2R5DQ14738 602 aa28.14■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQUBQ8NA54 791 aa28.14■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX21Q969T3 373 aa28.14■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC46A2Q9BY10 475 aa28.14■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIX4Q9UIU6 781 aa28.14■■■□□ 2.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLCB2Q00722 1185 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC32Q14392 662 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SURF1Q15526 300 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHC4Q6S5L8 630 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCLK2Q8N568 766 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOP6BLQ8N6T0 577 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC8Q8TAM2 541 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA18Q8TC71 538 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INTS13Q9NVM9 706 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTSE1Q9NYZ3 720 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYBPHLA2RUH7 354 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LILRB5O75023 590 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNNC2P02585 160 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F11P03951 625 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSH1P0DML2 217 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSH2P0DML3 217 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR15P49685 360 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCR3P51677 355 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLRP12P59046 1061 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO1EQ12965 1108 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM150AQ86TG1 271 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBWD2Q8IUF1 395 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRF2Q8IZF7 708 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CMTM8Q8IZV2 173 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCB6Q9NP58 842 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPBP1Q9NZL4 362 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF3C4Q9UKN8 822 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTHP32929 405 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXD13P35453 343 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LHX1P48742 406 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRLP54845 237 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXK2Q01167 660 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUOXA2Q1HG44 320 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNNM4Q6P4Q7 775 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSTM1Q86WC4 334 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5B17Q8NGF7 314 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPC1Q9H2F5 836 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1586Q9HCI6 787 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCDNQ9UBB6 729 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR179Q6PRD1 2367 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DMXL1Q9Y485 3027 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRJQ12913 1337 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TDGF1P13385 188 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2F1P24903 491 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCSK1P29120 753 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AVPR1AP37288 418 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDR2Q16832 855 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOWAHAQ2M3V2 549 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM26FQ5R3K3 315 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDHAF4Q5VUM1 108 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TXNDC11Q6PKC3 985 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAB21L3Q8N8X9 362 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STKLD1Q8NE28 680 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF507Q8TCN5 953 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HPDLQ96IR7 371 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PKMYT1Q99640 499 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C7orf25Q9BPX7 421 aa28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABRDO14764 452 aa28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXCL12P48061 93 aa28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNK2Q07912 1038 aa28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPH6Q7L8W6 267 aa28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSCBQ8IWL3 235 aa28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEF1Q9HAY2 307 aa28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAS6Q14393 721 aa28.08■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa28.08■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DGKKQ5KSL6 1271 aa28.08■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR49Q8IV35 697 aa28.08■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPEM1Q8N4L4 309 aa28.08■■■□□ 2.09
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