Protein–RNA interactions for Protein: Q99640

PKMYT1, Membrane-associated tyrosine- and threonine-specific cdc2-inhibitory kinase, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKMYT1Q99640 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PKMYT1Q99640 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PKMYT1Q99640 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PKMYT1Q99640 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PKMYT1Q99640 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PKMYT1Q99640 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PKMYT1Q99640 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PKMYT1Q99640 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PKMYT1Q99640 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PKMYT1Q99640 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PKMYT1Q99640 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PKMYT1Q99640 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PKMYT1Q99640 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PKMYT1Q99640 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PKMYT1Q99640 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PKMYT1Q99640 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PKMYT1Q99640 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PKMYT1Q99640 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PKMYT1Q99640 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PKMYT1Q99640 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PKMYT1Q99640 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PKMYT1Q99640 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PKMYT1Q99640 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PKMYT1Q99640 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PKMYT1Q99640 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKMYT1Q99640 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PKMYT1Q99640 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKMYT1Q99640 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKMYT1Q99640 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PKMYT1Q99640 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PKMYT1Q99640 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PKMYT1Q99640 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PKMYT1Q99640 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKMYT1Q99640 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PKMYT1Q99640 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PKMYT1Q99640 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PKMYT1Q99640 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PKMYT1Q99640 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PKMYT1Q99640 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKMYT1Q99640 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PKMYT1Q99640 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PKMYT1Q99640 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PKMYT1Q99640 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PKMYT1Q99640 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PKMYT1Q99640 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PKMYT1Q99640 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PKMYT1Q99640 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PKMYT1Q99640 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PKMYT1Q99640 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PKMYT1Q99640 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKMYT1Q99640 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PKMYT1Q99640 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PKMYT1Q99640 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PKMYT1Q99640 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PKMYT1Q99640 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKMYT1Q99640 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PKMYT1Q99640 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PKMYT1Q99640 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PKMYT1Q99640 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PKMYT1Q99640 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PKMYT1Q99640 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PKMYT1Q99640 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKMYT1Q99640 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PKMYT1Q99640 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PKMYT1Q99640 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PKMYT1Q99640 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PKMYT1Q99640 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PKMYT1Q99640 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PKMYT1Q99640 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PKMYT1Q99640 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PKMYT1Q99640 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PKMYT1Q99640 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKMYT1Q99640 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PKMYT1Q99640 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKMYT1Q99640 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKMYT1Q99640 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKMYT1Q99640 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKMYT1Q99640 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKMYT1Q99640 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PKMYT1Q99640 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKMYT1Q99640 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKMYT1Q99640 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKMYT1Q99640 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKMYT1Q99640 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKMYT1Q99640 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKMYT1Q99640 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PKMYT1Q99640 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PKMYT1Q99640 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PKMYT1Q99640 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PKMYT1Q99640 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKMYT1Q99640 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKMYT1Q99640 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKMYT1Q99640 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKMYT1Q99640 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKMYT1Q99640 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKMYT1Q99640 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PKMYT1Q99640 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PKMYT1Q99640 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKMYT1Q99640 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKMYT1Q99640 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms