RNA–Protein interactions for RNA: YNR040W

YNR040W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNR040W, Length 771 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR040W	YNR040W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
YNR040W	YNR040W	SAS2	P40963	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	HIT1	P46973	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YJL118W	P47022	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	TAX4	P47030	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	LST7	P53237	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	SED1	Q01589	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	NAT3	Q06504	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	LDS2	Q08218	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	DCN1	Q12395	269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	SPS18	P32572	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YIL077C	P40508	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	BLM10	P43583	2143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	GPI2	P46961	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	CRH1	P53301	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	API2	Q04413	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	POS5	Q06892	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
YNR040W	YNR040W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YGL010W	P25338	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	AVT5	P38176	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	ECM14	P38836	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	MCH1	Q07376	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	IRC25	Q07951	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	COA6	Q3E846	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	DAL80	P26343	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	DAD2	P36162	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	CTR2	P38865	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YAR068W	P39564	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	DSK2	P48510	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YIP1	P53039	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YGL185C	P53100	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YNR064C	P53750	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YHP1	Q04116	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	ARR2	Q06597	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	PMU1	P36069	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YBL071C	P38185	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	CYT2	Q00873	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	IES6	P32617	166 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	PHD1	P36093	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	ICS2	P38284	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	RPB11	P38902	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YIL163C	P40448	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YFL015C	P43578	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YGR149W	P48236	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YNR071C	P53757	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	STD1	Q02794	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	SDH7	Q04401	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	NDE2	Q07500	545 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	GEP5	Q12393	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	GPI18	P38211	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	CSH1	P38287	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YHR173C	P38864	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	LST8	P41318	303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	ERV14	P53173	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNR040W	YNR040W	SRP21	P32342	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	YHL044W	P38727	235 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	DOG2	P38773	246 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	DOG1	P38774	246 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	BDH1	P39714	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	SBH2	P52871	88 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	MRX11	Q03079	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	SFT2	P38166	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	SRP14	P38985	146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	MIX17	Q03667	156 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	SEN15	Q04675	128 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNR040W	YNR040W	FIT2	Q08906	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.5 ms