RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		-1.6	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	BNI1	P41832	1953 aa		-1.61	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	SPT14	P32363	452 aa		-1.61	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	IGO2	Q9P305	131 aa		-1.61	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	-1.62	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		-1.63	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	-1.63	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	SOL1	P50278	321 aa		-1.63	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	MMS2	P53152	137 aa		-1.63	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	RTC4	P53850	401 aa		-1.63	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	RIB3	Q99258	208 aa		-1.63	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	SPS2	P08459	502 aa		-1.64	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	YEL073C	P39974	107 aa		-1.65	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	YEL014C	P39999	101 aa		-1.65	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	RNH1	Q04740	348 aa		-1.65	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	CMC4	Q3E7A9	73 aa		-1.65	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	-1.66	□□□□□ -2.67
VAR1	Q0140	YJL009W	P47078	108 aa		-1.66	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	ARO80	Q04052	950 aa		-1.66	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	-1.67	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	CPR5	P35176	225 aa		-1.67	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	-1.68	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	HTB2	P02294	131 aa		-1.68	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	-1.68	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	YOR214C	Q12282	236 aa		-1.68	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	HSL1	P34244	1518 aa		-1.68	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	PHO13	P19881	312 aa		-1.69	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	-1.69	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		-1.69	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	HSP150	P32478	413 aa		-1.7	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	ECM31	P38122	312 aa		-1.7	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	-1.7	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	-1.71	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	-1.71	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	COA6	Q3E846	104 aa		-1.71	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	RAD6	P06104	172 aa		-1.72	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	YOL024W	Q08172	172 aa		-1.72	□□□□□ -2.68
VAR1	Q0140	CAF4	P36130	643 aa		-1.73	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	CSH1	P38287	376 aa		-1.73	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	MSS2	P40990	351 aa		-1.73	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	AIM34	Q03673	198 aa		-1.73	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	YDL241W	Q07738	123 aa		-1.73	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	IRC21	Q04772	201 aa		-1.74	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	-1.74	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	MYO1	P08964	1928 aa		-1.75	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	-1.75	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	INO4	P13902	151 aa		-1.75	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	HOP2	P53187	214 aa		-1.76	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		-1.76	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	TIM13	P53299	105 aa		-1.77	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		-1.78	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		-1.78	□□□□□ -2.69
VAR1	Q0140	TRM3	Q07527	1436 aa		-1.79	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	UIP4	Q08926	304 aa		-1.79	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	YEL028W	P39989	153 aa		-1.8	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	-1.8	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	LIP1	Q03579	150 aa		-1.8	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	AHC2	P25649	128 aa		-1.81	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	YKL102C	P34249	101 aa		-1.82	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	IPT1	P38954	527 aa		-1.82	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	TRX3	P25372	127 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	-1.83	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	FMP32	P43557	207 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	TTI2	P47168	421 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	SHH4	Q06236	168 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	SYM1	Q06563	197 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	ATG10	Q07879	167 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	FIT3	Q08907	204 aa		-1.83	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	-1.84	□□□□□ -2.7
VAR1	Q0140	CBF1	P17106	351 aa		-1.85	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	DIE2	P50076	525 aa		-1.85	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	RAD9	P14737	1309 aa		-1.86	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	ARG80	P07249	177 aa		-1.86	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	QCR7	P00128	127 aa		-1.87	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	PGA2	P53903	129 aa		-1.88	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	-1.88	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	-1.89	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	YPR114W	Q06107	315 aa		-1.89	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	-1.89	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	-1.9	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	-1.9	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	-1.9	□□□□□ -2.71
VAR1	Q0140	NUF2	P33895	451 aa		-1.91	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	-1.91	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	GIS3	Q12418	502 aa		-1.92	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		-1.93	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	SRL3	P36167	246 aa		-1.94	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	PEX34	P25584	144 aa		-1.95	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	XPT1	P47165	209 aa		-1.95	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	EST3	Q03096	181 aa		-1.95	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	YMR122C	Q03879	124 aa		-1.95	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	GRE1	Q08969	168 aa		-1.95	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	GPI11	Q06636	219 aa		-1.96	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	EMC4	P53073	190 aa		-1.97	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	-1.97	□□□□□ -2.72
VAR1	Q0140	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	-1.98	□□□□□ -2.73
VAR1	Q0140	GRX8	Q05926	109 aa		-1.98	□□□□□ -2.73
VAR1	Q0140	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		-1.99	□□□□□ -2.73
VAR1	Q0140	AUA1	P32450	94 aa		-1.99	□□□□□ -2.73
VAR1	Q0140	YNR064C	P53750	290 aa		-1.99	□□□□□ -2.73

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