RNA–Protein interactions for RNA: YLR089C

ALT1, Transcript of Alanine transaminase (glutamic pyruvic transaminase), yeast

Gene ALT1, Length 1,779 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ALT1	YLR089C	TPC1	P53257	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	YNR048W	P53740	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	APJ1	P53940	528 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	GPI15	P53961	229 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	PAU23	Q07987	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	PAU17	Q12370	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	YPS1	P32329	569 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	UTR5	P32630	166 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	YKR041W	P36134	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	SPC25	P40014	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	AVT7	P40501	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
ALT1	YLR089C	POP1	P41812	875 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	PRY1	P47032	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	TAD2	P47058	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	RAV2	Q03956	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	FRE7	Q12333	620 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	YLR118C	Q12354	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	ORT1	Q12375	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	EAF3	Q12432	401 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	RPB8	P20436	146 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	LDB16	P25587	256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	CLB6	P32943	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	MIG1	P27705	504 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	SFK1	P35735	353 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	SPO73	P40031	143 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	PRM8	P53174	237 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ALT1	YLR089C	HFA1	P32874	2273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	ECM34	P38728	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	ANS1	P38832	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YDL186W	P48568	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	MMS2	P53152	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	NCE101	Q02820	53 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	INP1	Q03694	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	COQ11	Q05892	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	UBC5	P15732	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	PHO85	P17157	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YKL187C	P34231	750 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SAS2	P40963	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YFL065C	P43539	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SNO3	P43544	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	UBC11	P52492	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YGL230C	P53074	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	AIM11	P87275	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	NUP53	Q03790	475 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	TDA6	Q06466	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	LOA1	Q06508	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YPR203W	Q08994	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	MRP17	P28778	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YIL059C	P40520	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	WSC2	P53832	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	ANT1	Q06497	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	SOR2	Q07786	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YPL278C	Q08990	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	GLE2	P40066	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	PRM5	P40476	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	MSY1	P48527	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	TOS2	P50078	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ALT1	YLR089C	YIP5	P53108	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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