RNA–Protein interactions for RNA: YJL113W

YJL113W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YJL113W, Length 4,647 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL113WYJL113W ECM31P38122 312 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W HHY1P39982 102 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W LST8P41318 303 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W MST27P53176 234 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RPM2Q02773 1202 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W SNZ1Q03148 297 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W UPS1Q05776 175 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YPR098CQ06089 161 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W SRB4P32569 687 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YBR144CP34215 104 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RPC37P36121 282 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W UTP30P36144 274 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W SLM4P38247 162 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YMR141CP40211 102 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YGR026WP53217 278 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W PAU12P53343 120 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W SNO1Q03144 224 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YMR181CQ03231 154 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W USB1Q12208 290 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W NKP1Q12493 238 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YKL063CP35725 167 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W BLI1P35727 113 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W SRP68P38687 599 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YHR173CP38864 112 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W DLS1P40366 167 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RMR1P53060 241 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YGR017WP53210 297 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W OKP1P53298 406 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W ARC35P53731 342 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RTC4P53850 401 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W GPI15P53961 229 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W SRL2Q12020 392 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W PSF1Q12488 208 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W TDA8Q6B2U8 126 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YLR255CO13574 117 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W CDC37P06101 506 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W PAU19P0CE85 124 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W PAU21P0CE86 164 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W PAU22P0CE87 164 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W PAU3P25610 124 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W NTG1P31378 399 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W KTI12P34253 313 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W FRM2P37261 193 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W PDX3P38075 228 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W PAU15P40585 124 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W ICS3P47034 131 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YGL185CP53100 379 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W HOP2P53187 214 aa-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.66□□□□□ -2.51not detected
YJL113WYJL113W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W TIR1P10863 254 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W FUN26P31381 517 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W IKI1P38874 309 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W IRC22P40006 225 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W FLX1P40464 311 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W LST7P53237 242 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YKR005CQ02203 525 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W MET31Q03081 177 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W GPI11Q06636 219 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W HIS1P00498 297 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W HIS3P06633 220 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W DSF1P0CX08 502 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YNR073CP0CX09 502 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W ATP10P18496 279 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YEA4P40004 342 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W LIA1P47120 325 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W TIM21P53220 239 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W YDR249CQ03787 373 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W HSP31Q04432 237 aa-0.66□□□□□ -2.51
YJL113WYJL113W VPS63O13549 108 aa-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W SEC17P32602 292 aa-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W RPF1P38805 295 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W RPC10P40422 70 aa-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W CIN5P40917 295 aa-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W YJL028WP47062 111 aa-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W PDR17P53844 350 aa-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W TMA23Q03525 211 aa-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W IRC21Q04772 201 aa-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W COX19Q3E731 98 aa-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W YGR035W-AQ45U48 73 aa-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W HPM1P40481 377 aa-0.66□□□□□ -2.52
YJL113WYJL113W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
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