RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W PGA1P53896 198 aa4.48□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W OPI3P05375 206 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YAR066WP0CX18 203 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YHR214WP0CX19 203 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W MAK32P23060 363 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YCR099CP25657 155 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W PRE2P30656 287 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W MLF3P32047 452 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W SPS18P32572 300 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YJL213WP40896 331 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W SCW4P53334 386 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YNL165WP53891 406 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W HSK3P69852 69 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W INP1Q03694 420 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YMR087WQ04299 284 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W DGA1Q08650 418 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YDR215CQ12240 137 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ICT1Q12385 394 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W IZH2Q12442 317 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W ZPS1Q12512 249 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W APC1P53886 1748 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YND1P40009 630 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W OST2P46964 130 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W SDC1Q03323 175 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YPL264CQ08980 353 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W YMR030W-AQ3E760 96 aa4.47□□□□□ -1.69
CYK3YDL117W FMP49A0A023PZB3 126 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W ERG24P32462 438 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W IES6P32617 166 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W SDS24P38314 527 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data4.46□□□□□ -1.7not detected
CYK3YDL117W UBX6P47049 396 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W ARP3P47117 449 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W GEP7P53171 287 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W FIT3Q08907 204 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W ECM12O13529 151 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W TRX3P25372 127 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YMC2P38087 329 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W TOS2P50078 622 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YLR152CP54072 576 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W MRX11Q03079 207 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W ADD37Q03233 198 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YPL162CQ12042 273 aa4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W RPS13P05756 151 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W UMP1P38293 148 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W SPL2P38839 148 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W RPB11P38902 120 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W CCS1P40202 249 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W PHS1P40857 217 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W UBP8P50102 471 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W PUS2P53167 370 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YGR219WP53307 113 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W CAB4P53332 305 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W FCY1Q12178 158 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YLR412C-AQ3E742 68 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W BOL1Q3E793 110 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W FKS3Q04952 1785 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W MRS1P07266 363 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W SFT1P43682 97 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W LYS5P50113 272 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W NRG1Q03125 231 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W PEX11Q12462 236 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W ATG40Q99325 256 aa4.45□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W RPL28P02406 149 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W CHO1P08456 276 aa4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W CYB5P40312 120 aa4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YFL012WP43580 148 aa4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W EMC4P53073 190 aa4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YMR103CQ04436 120 aa4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W CRD1Q07560 283 aa4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W MKK1P32490 508 aa4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W ASK1P35734 292 aa4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W HNT2P49775 206 aa4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W LSM3P57743 89 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YEA4P40004 342 aa4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YER079WP40052 210 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W BUD8P41698 603 aa4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W TEX1P53851 422 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YPL039WQ03080 316 aa4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YLR346CQ06139 101 aa4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W MCA1Q08601 432 aa4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W KRE1P17260 313 aa4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YCR085WP25650 117 aa4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W MRPS5P33759 307 aa4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W PEX22P39718 180 aa4.43□□□□□ -1.7
CYK3YDL117W YJL028WP47062 111 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.8 ms