RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C UBC12P52491 188 aa0.81□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C ARO8P53090 500 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C MPA43P53583 542 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C ARO80Q04052 950 aa0.81□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C DYN3Q04949 312 aa0.81□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C MSB2P32334 1306 aa0.8□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YAR023CD6VPM8 179 aa0.8□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YER134CP40081 178 aa0.8□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C PDS1P40316 373 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C RTC4P53850 401 aa0.8□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YHR007C-AQ07074 71 aa0.8□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YLR031WQ07978 186 aa0.8□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa0.8□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YML100W-AQ8TGT0 57 aa0.8□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C SNF4P12904 322 aa0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C ADE1P27616 306 aa0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C UBC7Q02159 165 aa0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YMR295CQ03559 197 aa0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YOL024WQ08172 172 aa0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C IRC23Q08416 157 aa0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C TAH1P25638 111 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C MTW1P39731 289 aa0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C RIO2P40160 425 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C NAT3Q06504 195 aa0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YLR036CQ07986 203 aa0.79□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C MDM35O60200 86 aa0.78□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C TRX3P25372 127 aa0.78□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C CAF4P36130 643 aa0.78□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C ECM4P36156 370 aa0.78□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C FMP23P38231 175 aa0.78□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C TDA4P47153 279 aa0.78□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
HDA3YPR179C YBR056W-AI2HB52 66 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C MGT1P26188 188 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C PAM17P36147 197 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C FLX1P40464 311 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C GIM3P53900 129 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C RCE1Q03530 315 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C SHH3Q04487 196 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C RNH202Q05635 350 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C GRX8Q05926 109 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C TIR1P10863 254 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C NSP1P14907 823 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C CUP9P41817 306 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YFL019CP43576 117 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C TMA22P47089 198 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YAE1P47118 141 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C HOP2P53187 214 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YNL247WP53852 767 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C VPS71Q03433 280 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YPR013CQ12145 317 aa0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C PHO85P17157 305 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C SHG1P38337 142 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C EDC3P39998 551 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C HYR1P40581 163 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C PGA1P53896 198 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C NRK1P53915 240 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YNL033WP53964 284 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C DAD4P69851 72 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C CWC27Q02770 301 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C SNO1Q03144 224 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C AIM34Q03673 198 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YMR253CQ04835 414 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C FIT2Q08906 153 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C COX8P04039 78 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C AQY2P0CD90 149 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C SPC25P40014 221 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C DIG2Q03373 323 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YPR014CQ6B0W2 109 aa0.76□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C VAR1P02381 398 aa0.75□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C AHC2P25649 128 aa0.75□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C ATP7P30902 174 aa0.75□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YHL042WP38729 150 aa0.75□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YFH7P43591 353 aa0.75□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C GPI14P47088 403 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C THG1P53215 237 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YET3Q07451 203 aa0.75□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YOR342CQ12182 319 aa0.75□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YLR422WQ06409 1932 aa0.74□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data0.74□□□□□ -2.29not detected
HDA3YPR179C IDP1P21954 428 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C SFK1P35735 353 aa0.74□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YKR041WP36134 250 aa0.74□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C NSG1P38837 291 aa0.74□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C HPA3P39979 161 aa0.74□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YFL065CP43539 102 aa0.74□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C FMP32P43557 207 aa0.74□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C YMR252CQ04814 134 aa0.74□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C FYV12Q08559 129 aa0.74□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C GRE1Q08969 168 aa0.74□□□□□ -2.29
HDA3YPR179C MPD1Q12404 318 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
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