RNA–Protein interactions for RNA: YOR248W

YOR248W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YOR248W, Length 303 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR248W	YOR248W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YOR248W	YOR248W	CWC27	Q02770	301 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YOR248W	YOR248W	YMR295C	Q03559	197 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YOR248W	YOR248W	FIT2	Q08906	153 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YOR248W	YOR248W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YOR248W	YOR248W	IGO2	Q9P305	131 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YOR248W	YOR248W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YOR248W	YOR248W	MRS1	P07266	363 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	PAM17	P36147	197 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YHL042W	P38729	150 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	SER2	P42941	309 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YFL065C	P43539	102 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	AIM36	Q03798	255 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YPR013C	Q12145	317 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	COX8	P04039	78 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YEL008W	P40001	126 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YFH7	P43591	353 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	GGA1	Q06336	557 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	NTG1	P31378	399 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YMR252C	Q04814	134 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YPK2	P18961	677 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	CNB1	P25296	175 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	MTW1	P39731	289 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YER134C	P40081	178 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	UPS3	Q04006	179 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	SHH3	Q04487	196 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YMR253C	Q04835	414 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	RNH202	Q05635	350 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	RAD9	P14737	1309 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	STP22	P25604	385 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	CUP9	P41817	306 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	SBH1	P52870	82 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YNL033W	P53964	284 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	DYN3	Q04949	312 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YLR036C	Q07986	203 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	FYV12	Q08559	129 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	TRX3	P25372	127 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	MGT1	P26188	188 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YLR460C	P54007	376 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	MET31	Q03081	177 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	GET4	Q12125	312 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	QCR7	P00128	127 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	TIR1	P10863	254 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	ARO7	P32178	256 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	RPB7	P34087	171 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	CGR1	P53188	120 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	YNL184C	P53876	108 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	DAD4	P69851	72 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YOR248W	YOR248W	SFK1	P35735	353 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	HPA3	P39979	161 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	SPC25	P40014	221 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	VPS71	Q03433	280 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	NAT3	Q06504	195 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	YLR031W	Q07978	186 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	YOL024W	Q08172	172 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	SNF4	P12904	322 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	SEN2	P16658	377 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	YFL019C	P43576	117 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	PIR1	Q03178	341 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	RIF1	P29539	1916 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	UBC12	P52491	188 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	STF2	P16965	84 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	APA2	P22108	325 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	AHT1	P29589	182 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	RTC4	P53850	401 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	AIM34	Q03673	198 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	ARO80	Q04052	950 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	LCL2	Q08045	131 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YOR248W	YOR248W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32

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