RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W YER158CP40095 573 aa4.07□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YIL169CP40442 995 aa4.07□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W PCP1P53259 346 aa4.07□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W HOF1Q05080 669 aa4.07□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W MTC7P32633 139 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W SNC2P33328 115 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W CMC1P36064 111 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W DLS1P40366 167 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W UBX6P47049 396 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W SNN1P48232 102 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W SCW4P53334 386 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W MSO1P53604 210 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W RSM23Q01163 450 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W RSM10Q03201 203 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YFL068WP0CX99 160 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YLL066W-AP0CY00 160 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YLL067W-AP0CY01 160 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W SSS1P35179 80 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YGR149WP48236 432 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W POP6P53218 158 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W COX18P53239 316 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W AAH1P53909 347 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W TSA2Q04120 196 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W SRB6P32570 121 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W TIR2P33890 251 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W KTI12P34253 313 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W DOG1P38774 246 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YER076CP40049 302 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W MCH1Q07376 486 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data4.06□□□□□ -1.76not detected
YMR196WYMR196W YOR385WQ08909 290 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W ODC2Q99297 307 aa4.06□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W CYC7P00045 113 aa4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W NUD1P32336 851 aa4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W BXI1P48558 297 aa4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W LST7P53237 242 aa4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W SLM6P38343 150 aa4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YNL165WP53891 406 aa4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W VBA1Q04301 562 aa4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W CNL1Q06333 122 aa4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W TFC7Q12415 435 aa4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W POM34Q12445 299 aa4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W SPO24Q3E752 67 aa4.05□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W GDH1P07262 454 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W FUN14P18411 198 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YKL107WP34251 309 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YJR012CP47087 207 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W SKP1P52286 194 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YIP1P53039 248 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YGR151CP53287 111 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W COQ11Q05892 277 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W COX5BP00425 151 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W FCY2P17064 533 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W CKS1P20486 150 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data4.04□□□□□ -1.76not detected
YMR196WYMR196W AVT7P40501 490 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W CTK2P46962 323 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W GWT1P47026 490 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W ALG13P53178 202 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W MRPL22P53881 309 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W RNH201P53942 307 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W HHT1P61830 136 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W SEN15Q04675 128 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W AGA2P32781 87 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W PPZ2P33329 710 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W UMP1P38293 148 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W MTC6P38849 526 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YCT1Q12235 531 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W MCT1Q12283 360 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W RAX2Q12465 1220 aa4.04□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YER039C-AP0CD97 72 aa4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YPL067CQ02754 198 aa4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W LDS2Q08218 356 aa4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W ATP5P09457 212 aa4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W LSB5P25369 354 aa4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W IES6P32617 166 aa4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W FMT1P32785 401 aa4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W DAN1P47178 298 aa4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W MMS2P53152 137 aa4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YNR040WP53736 256 aa4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W RAD28Q12021 506 aa4.03□□□□□ -1.76
YMR196WYMR196W YBR085C-AO43137 85 aa4.03□□□□□ -1.77
YMR196WYMR196W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.77
YMR196WYMR196W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.77
YMR196WYMR196W YER190C-BP0CX94 160 aa4.03□□□□□ -1.77
YMR196WYMR196W YEL077W-AP0CX95 160 aa4.03□□□□□ -1.77
YMR196WYMR196W YGR296C-BP0CX96 160 aa4.03□□□□□ -1.77
YMR196WYMR196W YPL283W-BP0CX97 160 aa4.03□□□□□ -1.77
YMR196WYMR196W YPR204C-AP0CX98 160 aa4.03□□□□□ -1.77
YMR196WYMR196W YKR041WP36134 250 aa4.03□□□□□ -1.77
YMR196WYMR196W GAT2P40209 560 aa4.03□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 189.6 ms