RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	RRT5	P43607	289 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	OST2	P46964	130 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MNN5	P46982	586 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	GWT1	P47026	490 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	AIF1	P52923	378 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MDM34	P53083	459 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MCH1	Q07376	486 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	DGA1	Q08650	418 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	TIM18	Q08749	192 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YOR376W	Q08900	122 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	PFA4	Q12006	378 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	PRR2	Q12310	699 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	PRM4	Q12498	284 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MHF1	Q3E835	90 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	RIF1	P29539	1916 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	STE7	P06784	515 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	CCA1	P21269	546 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YEL028W	P39989	153 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YFL012W	P43580	148 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	BOL2	P53082	120 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	CLD1	P53264	445 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	TIM13	P53299	105 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	CAB4	P53332	305 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	NRM1	P53718	249 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	VHS1	Q03785	461 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YMR321C	Q04898	105 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YLR118C	Q12354	227 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MOT1	P32333	1867 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.3	□□□□□ -1.88	not detected
PAM18	YLR008C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	PCL1	P24867	279 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	STP22	P25604	385 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	AGA1	P32323	725 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YOR062C	P36025	268 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	AVT6	P40074	448 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YPL073C	P40323	161 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	CFD1	P40558	293 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	LCB3	P47013	409 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YGL034C	P53186	121 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	TPC1	P53257	314 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	HHO1	P53551	258 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	ODC1	Q03028	310 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	SDC1	Q03323	175 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YPR114W	Q06107	315 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YOR186W	Q08560	144 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MHF2	Q3E829	80 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	COX4	P04037	155 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	STF2	P16965	84 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	PHO85	P17157	305 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	SEC59	P20048	519 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	TKL2	P33315	681 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	PTC1	P35182	281 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	GPX1	P36014	167 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MRPL15	P36523	253 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YHL026C	P38740	315 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	HEM14	P40012	539 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MOB1	P40484	314 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YJL043W	P47053	257 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	VPS71	Q03433	280 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	GAS3	Q03655	524 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	GPI11	Q06636	219 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	SLD7	Q08457	257 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	FCY1	Q12178	158 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	VAR1	P02381	398 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	AQY1	P0CD91	305 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	SPO13	P23624	291 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YPT53	P36019	220 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MBA1	P38300	278 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MED6	P38782	295 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	IPT1	P38954	527 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	AVT7	P40501	490 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	MRH4	P53166	561 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	YGR039W	P53225	103 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	FMP48	P53233	369 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	ERV29	P53337	310 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PAM18	YLR008C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88

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