RNA–Protein interactions for RNA: YJR138W

IML1, Transcript of GTPase-activating protein (GAP), subunit of SEA and Iml1p complexes, yeast

Gene IML1, Length 4,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IML1	YJR138W	SDH8	P38345	138 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	NVJ1	P38881	321 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	LCL1	Q02786	101 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	ATG17	Q06410	417 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	SYM1	Q06563	197 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YPL199C	Q08954	240 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	ATX2	Q12067	313 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	RTC6	O14464	93 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	DDI2	P0CH63	225 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	DDI3	P0CH64	225 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	PET122	P10355	254 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	REC104	P33323	182 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	HXT14	P42833	540 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	BET5	Q03630	159 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	PUT1	P09368	476 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	NTG1	P31378	399 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	SOH1	P38633	127 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YAR029W	P39549	74 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	HPM1	P40481	377 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	CAT5	P41735	233 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	GPI2	P46961	280 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	NIF3	P53081	288 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	BRP1	P53194	125 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YDR366C	P87287	132 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	FRQ1	Q06389	190 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	UBA3	Q99344	299 aa		0.87	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	CPT1	P17898	393 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	PET18	P25362	215 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YKR045C	P36138	183 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	CSH1	P38287	376 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	TRM5	P38793	499 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	THI74	Q04083	370 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YPL264C	Q08980	353 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	CRC1	Q12289	327 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	ATO3	Q12359	275 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	RPL12B	P0CX54	165 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	PUP1	P25043	261 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	FMT1	P32785	401 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.86	□□□□□ -2.27	not detected
IML1	YJR138W	PAU24	P38155	120 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YBR184W	P38299	523 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	SIM1	P40472	476 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	RPR2	P40571	144 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	MIC26	P50087	233 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YGR018C	P53211	109 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YNL234W	P53857	426 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	PHO92	Q06390	306 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	SCP1	Q08873	200 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	STE18	P18852	110 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	CPR2	P23285	205 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YKL063C	P35725	167 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	EMC5	P40540	141 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	IMP2	P46972	177 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	VOA1	P53262	265 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	HLR1	Q04429	423 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.86	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	CMC1	P36064	111 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	FMP33	P46998	180 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YGR151C	P53287	111 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	MEH1	Q02205	184 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	PAM18	Q07914	168 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	AEP3	Q12089	606 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	MRP17	P28778	131 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	CPD1	P53314	239 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	HST4	P53688	370 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	EST3	Q03096	181 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	EAF3	Q12432	401 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	POM34	Q12445	299 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	PEX7	P39108	375 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	CIN4	P39110	191 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	PCL6	P40038	420 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YFL015C	P43578	164 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	UBP8	P50102	471 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YNR071C	P53757	342 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	OCA2	P53949	197 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	USV1	Q12132	391 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	JID1	Q12350	301 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	QCR2	P07257	368 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	AST1	P35183	429 aa		0.85	□□□□□ -2.27
IML1	YJR138W	ERP5	P38819	212 aa		0.85	□□□□□ -2.27

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.6 ms