RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W BGL2P15703 313 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPS2P25443 254 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ERG24P32462 438 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W DLS1P40366 167 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RMD9P53140 646 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PGA1P53896 198 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W CNL1Q06333 122 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PAU23Q07987 124 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ERV2Q12284 196 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PRR2Q12310 699 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PAU17Q12370 124 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W CPR2P23285 205 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W HMX1P32339 317 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W IML3P38265 245 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YHL044WP38727 235 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W APQ12P40532 138 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W IKS1P47042 667 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YGR066CP53242 292 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ISA2Q12425 185 aa3.32□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data3.31□□□□□ -1.88not detected
HCA4YJL033W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ECM15P35195 104 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPS20P38701 121 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W SNU13P39990 126 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W HEM14P40012 539 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W OTU1P43558 301 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W CIN2P46670 268 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W EOS1P53938 366 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W BUD25P85052 153 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YPL077CQ02831 240 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W BSC6Q08280 497 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data3.31□□□□□ -1.88not detected
HCA4YJL033W RAX2Q12465 1220 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W HUT1Q12520 339 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W OLE1P21147 510 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ERG3P32353 365 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W MIX23P38162 196 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W QDR3P38227 689 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W WSS1P38838 269 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YIL067CP40514 678 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PHS1P40857 217 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W NIF3P53081 288 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W HHT1P61830 136 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W IZH2Q12442 317 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W STT4P37297 1900 aa3.31□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ANB1P19211 157 aa3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YPT35P38815 214 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W SEI1Q06058 285 aa3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YDL157CQ12082 118 aa3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W CSF1Q12150 2958 aa3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W CBS1P14066 229 aa3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YKL097CP34245 136 aa3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PMU1P36069 295 aa3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W DOG1P38774 246 aa3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ELC1Q03071 99 aa3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YCR075W-AQ3E830 75 aa3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ODC2Q99297 307 aa3.3□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W FAB1P34756 2278 aa3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YPR096CO13587 100 aa3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W MBF1O14467 151 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W PAI3P01094 68 aa3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W POR1P04840 283 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W TIR1P10863 254 aa3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W SPT15P13393 240 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPB5P20434 215 aa3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YSR3P23501 404 aa3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W TIM10P87108 93 aa3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YOR338WQ99326 363 aa3.29□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W STF1P01098 86 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W MRS3P10566 314 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W MRS4P23500 304 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W FMT1P32785 401 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YEA6P39953 335 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W SMD3P43321 101 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W ERG25P53045 309 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPN14P53196 417 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W SCW10Q04951 389 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W LOA1Q06508 300 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YOL024WQ08172 172 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W DAL82P21705 255 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RML2P32611 393 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W MNS1P32906 549 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W KKQ8P36004 724 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W SHO1P40073 367 aa3.28□□□□□ -1.88
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