RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MSY1	P48527	492 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	CAB4	P53332	305 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	VPS71	Q03433	280 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	AAC1	P04710	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RIP1	P08067	215 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	QRI5	P32344	111 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	PRY1	P47032	299 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	COX5A	P00424	153 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	NUD1	P32336	851 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	CLB6	P32943	380 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
MSC7	YHR039C	YFR045W	P43617	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	DUG3	P53871	357 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	LOA1	Q06508	300 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	SIR2	P06700	562 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	COX13	P32799	129 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	AVT2	P39981	480 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	SYS1	P41544	203 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	PAM16	P42949	149 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	TTI2	P47168	421 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	HST4	P53688	370 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	CYT2	Q00873	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RNH203	Q12338	110 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	PMD1	P32634	1753 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	KAR4	P25583	335 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MKK1	P32490	508 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	POP8	P38208	133 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	GEP4	P38812	185 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	CAT5	P41735	233 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YFL065C	P43539	102 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ATG18	P43601	500 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RRT5	P43607	289 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	PUS2	P53167	370 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ASA1	Q06822	443 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YPR203W	Q08994	102 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	FIG2	P25653	1609 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MIG1	P27705	504 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ATS1	P31386	333 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ACB1	P31787	87 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	PRO1	P32264	428 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SDH4	P37298	181 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SPL2	P38839	148 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	RPB11	P38902	120 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	AVT7	P40501	490 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ATP23	P53722	227 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SHH4	Q06236	168 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YIL029C	P40538	142 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YFR054C	P43622	192 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	GEP7	P53171	287 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	NMA2	P53204	395 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SLG1	P54867	378 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	KEI1	Q06346	221 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	PIN3	Q06449	215 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SOR2	Q07786	357 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	PAU23	Q07987	124 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	NAT5	Q08689	176 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YPS3	Q12303	508 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	PAU17	Q12370	124 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	IZH2	Q12442	317 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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