RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	TTI2	P47168	421 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	AIF1	P52923	378 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	COS10	P52924	374 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	YPL039W	Q03080	316 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	TMA23	Q03525	211 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	DML1	Q03652	475 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	YMR244W	Q04018	355 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	MCH1	Q07376	486 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	SRP21	P32342	167 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	SPT14	P32363	452 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	YBL010C	P32788	280 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	ZRT3	P34240	503 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	YBR220C	P38318	560 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	AIM2	P39721	246 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	SER2	P42941	309 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	RPA43	P46669	326 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	GPI2	P46961	280 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	XPT1	P47165	209 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	NDD1	Q08887	554 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	IZH2	Q12442	317 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLX8	YER116C	TRM732	Q03496	1420 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	ATP5	P09457	212 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YOR062C	P36025	268 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	SKG1	P36169	355 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YBR242W	P38331	238 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	COS8	P38723	381 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YHL026C	P38740	315 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YHR140W	P38842	239 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	SFT1	P43682	97 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YGL193C	P53097	103 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	APJ1	P53940	528 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	AIM11	P87275	137 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	SCW10	Q04951	389 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YOL014W	Q08110	124 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YLR462W	O13556	202 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	CCA1	P21269	546 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	BET1	P22804	142 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	PCL1	P24867	279 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YEL075C	P39972	122 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	TDA4	P47153	279 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	ZEO1	Q08245	113 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	JID1	Q12350	301 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	PST1	Q12355	444 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	ATG5	Q12380	294 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	HAP2	P06774	265 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YLR156W	P0CE96	114 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YLR159W	P0CE97	114 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YLR161W	P0CE98	114 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	PTC1	P35182	281 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	NSG1	P38837	291 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YAR068W	P39564	161 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YER181C	P40097	107 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	MIC19	P43594	170 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YGL118C	P53132	145 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	API2	Q04413	109 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	PAN1	P32521	1480 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	GPA2	P10823	449 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	MOB1	P40484	314 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	SYS1	P41544	203 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	PAC10	P48363	199 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YNL033W	P53964	284 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YNL019C	P53975	284 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	MCP1	Q12106	302 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	REV3	P14284	1504 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	SDH3	P33421	198 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	TEM1	P38987	245 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YFL019C	P43576	117 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	BUD25	P85052	153 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	UBR1	P19812	1950 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SLX8	YER116C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 92.9 ms