RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 NPR3P17342 541 aa11.67□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 GPS1Q13098 491 aa11.67□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF544Q6NX49 715 aa11.67□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.67□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A0X1KG70 313 aa11.67□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 ARL3P36405 182 aa11.67□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 GLI2P10070 1586 aa11.67□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 BTBD18B2RXH4 712 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 FANCBQ8NB91 859 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 VWA5AO00534 786 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 CHN1P15882 459 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 NOD2Q9HC29 1040 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 TUBA1BP68363 451 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 TUBA1AQ71U36 451 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 PPM1NQ8N819 430 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 CNPY3Q9BT09 278 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 STMND1H3BQB6 276 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 SFNP31947 248 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 ACAP3Q96P50 834 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 PSD3Q9NYI0 1048 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A0G2JPF8 293 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 KCNQ3O43525 872 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 PALMO75781 387 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 CITED4Q96RK1 184 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 BRAFP15056 766 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 ATP6V1C1P21283 382 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 STAT5AP42229 794 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 STAT5BP51692 787 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 MAGED4Q96JG8 741 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 CARD8Q9Y2G2 431 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 ADGRA2Q96PE1 1338 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 E9PBE3 544 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 CALB1P05937 261 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 NEK5Q6P3R8 708 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 KCNA6P17658 529 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 COPAP53621 1224 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 WNK4Q96J92 1243 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 TRABDQ9H4I3 376 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 TNKSO95271 1327 aa11.66□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 SRP54P61011 504 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 STK4Q13043 487 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 RASGRF1Q13972 1273 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 CHRNA3P32297 505 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 IFNL3Q8IZI9 196 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 RBBP8Q99708 897 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 PPP6R2O75170 966 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 SRP72O76094 671 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 RPL19P84098 196 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 PACS2Q86VP3 889 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PQ27 194 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PQ64 194 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PQD8 194 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 YWHAQP27348 245 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 ANXA13P27216 316 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 CIITAP33076 1130 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 AP1S1P61966 158 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 RPS7P62081 194 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 RGS21Q2M5E4 152 aa11.65□□□□□ -0.54
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf189Q5VU69 101 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.1 ms