RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	UBP8	P50102	471 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	CTF19	Q02732	369 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	TSA2	Q04120	196 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YFH1	Q07540	174 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	MRP20	P32387	263 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	SNL1	P40548	159 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	AGX1	P43567	385 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	DOC1	P53068	250 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YGR219W	P53307	113 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	COX12	Q01519	83 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	RRG8	Q06109	277 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	PMR1	P13586	950 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	AHC2	P25649	128 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	MIC12	P38341	106 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	SIM1	P40472	476 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YPI1	P43587	155 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	ALG13	P53178	202 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	ERP6	P53198	216 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	MRPL22	P53881	309 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YPR013C	Q12145	317 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	ODC2	Q99297	307 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	GCN4	P03069	281 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	PET54	P10834	293 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YUH1	P35127	236 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.29	□□□□□ -1.88	not detected
YNL057W	YNL057W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	NVJ1	P38881	321 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	FCY21	P40039	528 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	PRM5	P40476	318 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	LST8	P41318	303 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	FMP33	P46998	180 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.29	□□□□□ -1.88	not detected
YNL057W	YNL057W	RKI1	Q12189	258 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	CDC23	P16522	626 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.28	□□□□□ -1.88	not detected
YNL057W	YNL057W	YMR31	P19955	123 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	FAR1	P21268	830 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	AST1	P35183	429 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YBR184W	P38299	523 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	MST28	P39552	234 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	DIE2	P50076	525 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	MST27	P53176	234 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	ERV29	P53337	310 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	ASM4	Q05166	528 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL057W	YNL057W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	URA6	P15700	204 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YLF2	P38746	405 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YIL060W	P40519	144 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	SYS1	P41544	203 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	CAF16	P43569	289 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	AGC1	Q12482	902 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	URA3	P03962	267 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	SEN2	P16658	377 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	IFM1	P25038	676 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YBR137W	P38276	179 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	MED8	P38304	223 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	TDA4	P47153	279 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	MIC26	P50087	233 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YGR042W	P53227	271 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	FYV6	P53913	173 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	HAL1	Q01766	294 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	TLG1	Q03322	224 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	ATG39	Q06159	398 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	BOL1	Q3E793	110 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	CDC34	P14682	295 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	SIP1	P32578	815 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	YAR068W	P39564	161 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YNL057W	YNL057W	MAK3	Q03503	176 aa		3.25	□□□□□ -1.89

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.2 ms