RNA–Protein interactions for RNA: YMR093W

UTP15, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP15, Length 1,542 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP15	YMR093W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		2.27	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MSF1	P08425	469 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	FUN14	P18411	198 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PET18	P25362	215 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MRP17	P28778	131 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SFK1	P35735	353 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.26	□□□□□ -2.05	not detected
UTP15	YMR093W	YMR262W	P38430	313 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	GGC1	P38988	300 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MEP1	P40260	492 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	CAT5	P41735	233 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	COX16	P47081	118 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	IBA57	P47158	497 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SOL1	P50278	321 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	FLC3	P53121	802 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MET31	Q03081	177 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RUB1	Q03919	77 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	GRX8	Q05926	109 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YPR127W	Q06494	345 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YOR376W	Q08900	122 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YOR114W	Q12219	294 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MHT1	Q12525	324 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		2.26	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YPR096C	O13587	100 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	CDC7	P06243	507 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	HAP2	P06774	265 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YOL163W	P0CF20	169 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SNC2	P33328	115 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MRPL15	P36523	253 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MRPL28	P36527	147 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YCR087C-A	P37263	153 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SMP1	P38128	452 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PAU24	P38155	120 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MAL32	P38158	584 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	POP7	P38291	140 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	EMC5	P40540	141 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MAL12	P53341	584 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	AAH1	P53909	347 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	NRK1	P53915	240 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ASI3	P53983	676 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	CYT2	Q00873	224 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.25	□□□□□ -2.05	not detected
UTP15	YMR093W	OST6	Q03723	332 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YMR253C	Q04835	414 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ELP6	Q04868	273 aa		2.25	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	QCR7	P00128	127 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SEC59	P20048	519 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	LDB7	P38210	180 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RRT13	P40042	185 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	FLX1	P40464	311 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YJR149W	P47177	404 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	COG7	P53195	279 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	TIM21	P53220	239 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PAU12	P53343	120 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	NRM1	P53718	249 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	EST3	Q03096	181 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YMR252C	Q04814	134 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YMR321C	Q04898	105 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RNH202	Q05635	350 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PIN3	Q06449	215 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	MMT2	Q08970	484 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	BTS1	Q12051	335 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	ERP3	Q12403	225 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	TFC7	Q12415	435 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	TAO3	P40468	2376 aa		2.24	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	VPS63	O13549	108 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PPH21	P23594	369 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	EHD3	P28817	500 aa		2.23	□□□□□ -2.05
UTP15	YMR093W	PAU2	P32612	120 aa		2.23	□□□□□ -2.05

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