RNA–Protein interactions for RNA: YBR246W

RRT2, Transcript of Methylesterase performing penultimate step of diphthamide biosynthesis, yeast

Gene RRT2, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT2	YBR246W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YPT53	P36019	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
RRT2	YBR246W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YGR066C	P53242	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YDR366C	P87287	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	BSC6	Q08280	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SRL2	Q12020	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	MCP1	Q12106	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	COA6	Q3E846	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	COX5B	P00425	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SGA1	P08019	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	CTA1	P15202	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RPB8	P20436	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	CPR2	P23285	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	PPH21	P23594	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ERG3	P32353	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	UMP1	P38293	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YEA6	P39953	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	GAT2	P40209	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	PAU15	P40585	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	COQ5	P49017	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	TRM9	P49957	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	DYN2	Q02647	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	PET191	Q02772	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	TMA23	Q03525	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RAD28	Q12021	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YCT1	Q12235	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	STE18	P18852	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	EHD3	P28817	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	MNS1	P32906	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YKL075C	P36083	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	WSS1	P38838	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YEA4	P40004	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SNO3	P43544	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YJR012C	P47087	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YGL185C	P53100	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YNR066C	P53752	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	EKI1	Q03764	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	ATC1	Q04005	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	GMC1	Q04399	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SHH3	Q04487	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	SEN15	Q04675	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	CTS2	Q06350	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRT2	YBR246W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	HAP3	P13434	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	ERG8	P24521	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	PPA2	P28239	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	AGA2	P32781	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	BDH1	P39714	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	XBP1	P40489	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	STD1	Q02794	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	RSM10	Q03201	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	THI74	Q04083	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	BNA5	Q05979	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	POM33	Q12164	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	UBA3	Q99344	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	POP5	P28005	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	RML2	P32611	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	FRM2	P37261	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	YBR292C	P38357	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	YHR180W	P38868	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	YER085C	P40058	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	AVT4	P50944	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRT2	YBR246W	MGA1	P53050	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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