RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TFC7	Q12415	435 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ISA2	Q12425	185 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	RIB3	Q99258	208 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	ATG40	Q99325	256 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	CYC3	P06182	269 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SIR2	P06700	562 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SEC22	P22214	214 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YCR001W	P25347	104 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	CDC50	P25656	391 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	NTG1	P31378	399 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	FUN26	P31381	517 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	FPR2	P32472	135 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	CAF4	P36130	643 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SLM4	P38247	162 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YBR285W	P38354	144 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	BIG1	P38813	335 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	AIM2	P39721	246 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	FCY21	P40039	528 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	AIM20	P40451	204 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YGR201C	P42936	225 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SSN8	P47821	323 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TPN1	P53099	579 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	CPD1	P53314	239 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TOM7	P53507	60 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	TLG1	Q03322	224 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	PBA1	Q05778	276 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MLC2	Q06580	163 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YDR029W	Q12111	104 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	CCW12	Q12127	133 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	AYT1	Q12226	474 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	SCM3	Q12334	223 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	JID1	Q12350	301 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	HUT1	Q12520	339 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		0.22	□□□□□ -2.37
AI1	Q0050	COX5B	P00425	151 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CAP2	P13517	287 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YPK2	P18961	677 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ARO7	P32178	256 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ZRT1	P32804	376 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SKG1	P36169	355 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	TCD1	P38756	429 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DOG2	P38773	246 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DOG1	P38774	246 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	IPT1	P38954	527 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR134W	P40207	237 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SAS2	P40963	338 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YFL019C	P43576	117 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NUP57	P48837	541 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGR042W	P53227	271 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	COS6	P53344	381 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YIP3	P53633	176 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MEH1	Q02205	184 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR155W	Q03795	547 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	LPP1	Q04396	274 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YLR194C	Q05777	254 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SPO77	Q06134	477 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ARV1	Q06541	321 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YDL114W	Q07530	308 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YOL085C	Q99345	113 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YLR462W	O13556	202 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	UBC4	P15731	148 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MRS4	P23500	304 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.21	□□□□□ -2.38	not detected
AI1	Q0050	YUH1	P35127	236 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	JNM1	P36224	373 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	LAG1	P38703	411 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YHL049C	P38722	271 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MAM33	P40513	266 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YFL012W	P43580	148 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	GPI2	P46961	280 aa		0.21	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGL034C	P53186	121 aa		0.21	□□□□□ -2.38

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