RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 TMX3Q96JJ7 454 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 RPS6KC1Q96S38 1066 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 LMBRD1Q9NUN5 540 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM140Q9NV12 185 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 ACTL7AQ9Y615 435 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 FRS3O43559 492 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 TYRP14679 529 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PCSK1P29120 753 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PTGS2P35354 604 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 ALDH1A3P47895 512 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 SNAPC2Q13487 334 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 VPS72Q15906 364 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 BMT2Q1RMZ1 405 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 RNF220Q5VTB9 566 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 IL31Q6EBC2 164 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 GADL1Q6ZQY3 521 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 HTR3DQ70Z44 454 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 SYT12Q8IV01 421 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 KRT78Q8N1N4 520 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 TFAP2CQ92754 450 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 MYOCQ99972 504 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 MRI1Q9BV20 369 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 WDCPQ9H6R7 721 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 POGKQ9P215 609 aa3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 LEFTY2O00292 366 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PMM2O15305 246 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 FAM20BO75063 409 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 MALP21145 153 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 CTGFP29279 349 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 RAP2BP61225 183 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 RAB1AP62820 205 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 FGL2Q14314 439 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 BRD3Q15059 726 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA0753Q2KHM9 967 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 METTL24Q5JXM2 366 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 SWSAP1Q6NVH7 229 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 EFCAB12Q6NXP0 572 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 LRTOMTQ8WZ04 291 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 BHMT2Q9H2M3 363 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PNPOQ9NVS9 261 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 MOCS1Q9NZB8 636 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 SORCS3Q9UPU3 1222 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 FAM50BQ9Y247 325 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.87□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 SLC5A1P13866 664 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 NEK3P51956 506 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 CLRN1P58418 232 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PLS1Q14651 629 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC157Q569K6 752 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 STRIP1Q5VSL9 837 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 OR10H5Q8NGA6 315 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 SLC35A4Q96G79 324 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PHACTR3Q96KR7 559 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 NDC1Q9BTX1 674 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 NUP62CLQ9H1M0 184 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 COMMD10Q9Y6G5 202 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 ZAR1LA6NP61 321 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 H3BUI4 141 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PJA2O43164 708 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 MGEA5O60502 916 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 ATP5JP18859 108 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 PEX2P28328 305 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 HTR3AP46098 478 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 SLC25A3Q00325 362 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 MORC3Q14149 939 aa3.86□□□□□ -1.79
CCDC82-202ENST00000423339 RABL3Q5HYI8 236 aa3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms