RNA–Protein interactions for RNA: YOL085C

YOL085C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YOL085C, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOL085C	YOL085C	PMD1	P32634	1753 aa		20	■□□□□ 0.79
YOL085C	YOL085C	SHC1	P39000	512 aa		19.99	■□□□□ 0.79
YOL085C	YOL085C	SAS4	Q04003	481 aa		19.99	■□□□□ 0.79
YOL085C	YOL085C	SWI1	P09547	1314 aa		19.99	■□□□□ 0.79
YOL085C	YOL085C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
YOL085C	YOL085C	ATG20	Q07528	640 aa		19.98	■□□□□ 0.79
YOL085C	YOL085C	CST6	P40535	587 aa		19.97	■□□□□ 0.79
YOL085C	YOL085C	FCP1	Q03254	732 aa		19.97	■□□□□ 0.79
YOL085C	YOL085C	YDR306C	Q06640	478 aa		19.97	■□□□□ 0.79
YOL085C	YOL085C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	19.96	■□□□□ 0.79
YOL085C	YOL085C	PEX21	P50091	288 aa		19.95	■□□□□ 0.78
YOL085C	YOL085C	PUS5	Q06244	254 aa		19.93	■□□□□ 0.78
YOL085C	YOL085C	MRP7	P12687	371 aa		19.92	■□□□□ 0.78
YOL085C	YOL085C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	19.92	■□□□□ 0.78
YOL085C	YOL085C	NUP133	P36161	1157 aa		19.92	■□□□□ 0.78
YOL085C	YOL085C	YJR008W	P47085	338 aa		19.92	■□□□□ 0.78
YOL085C	YOL085C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	19.91	■□□□□ 0.78
YOL085C	YOL085C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	19.91	■□□□□ 0.78
YOL085C	YOL085C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	19.9	■□□□□ 0.78
YOL085C	YOL085C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
YOL085C	YOL085C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
YOL085C	YOL085C	DPL1	Q05567	589 aa		19.85	■□□□□ 0.77
YOL085C	YOL085C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	19.84	■□□□□ 0.77
YOL085C	YOL085C	YGR122W	P53272	402 aa		19.84	■□□□□ 0.77
YOL085C	YOL085C	ITC1	P53125	1264 aa		19.83	■□□□□ 0.77
YOL085C	YOL085C	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
YOL085C	YOL085C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
YOL085C	YOL085C	DPH6	Q12429	685 aa		19.81	■□□□□ 0.76
YOL085C	YOL085C	YLR278C	Q05854	1341 aa		19.8	■□□□□ 0.76
YOL085C	YOL085C	MSM1	P22438	575 aa		19.8	■□□□□ 0.76
YOL085C	YOL085C	ICP55	P40051	511 aa		19.79	■□□□□ 0.76
YOL085C	YOL085C	PSH1	Q12161	406 aa		19.79	■□□□□ 0.76
YOL085C	YOL085C	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	19.78	■□□□□ 0.76	not detected
YOL085C	YOL085C	SWC3	P31376	625 aa		19.78	■□□□□ 0.76
YOL085C	YOL085C	SET4	P42948	560 aa		19.78	■□□□□ 0.76
YOL085C	YOL085C	KRE2	P27809	442 aa		19.77	■□□□□ 0.76
YOL085C	YOL085C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	19.77	■□□□□ 0.76
YOL085C	YOL085C	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
YOL085C	YOL085C	RAD24	P32641	659 aa		19.76	■□□□□ 0.75
YOL085C	YOL085C	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	19.75	■□□□□ 0.75
YOL085C	YOL085C	CDC45	Q08032	650 aa		19.75	■□□□□ 0.75
YOL085C	YOL085C	SAC3	P46674	1301 aa		19.74	■□□□□ 0.75
YOL085C	YOL085C	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	19.72	■□□□□ 0.75
YOL085C	YOL085C	FET4	P40988	552 aa		19.72	■□□□□ 0.75
YOL085C	YOL085C	YPP1	P46951	817 aa		19.72	■□□□□ 0.75
YOL085C	YOL085C	GLC3	P32775	704 aa		19.71	■□□□□ 0.75
YOL085C	YOL085C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	19.71	■□□□□ 0.75
YOL085C	YOL085C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	19.71	■□□□□ 0.75
YOL085C	YOL085C	MGM1	P32266	881 aa		19.7	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	SPL2	P38839	148 aa		19.7	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	UBP12	P39538	1254 aa		19.7	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	MTC5	Q03897	1148 aa		19.7	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	THI3	Q07471	609 aa		19.7	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	GAS5	Q08193	484 aa		19.7	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	19.7	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	UBX2	Q04228	584 aa		19.69	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	19.69	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	HXT10	P43581	546 aa		19.68	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	19.68	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	TIM50	Q02776	476 aa		19.68	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	CSI1	Q04368	295 aa		19.67	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	AIM7	Q12156	149 aa		19.67	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	AFG2	P32794	780 aa		19.66	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	VHR2	P40041	505 aa		19.66	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	19.66	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	19.65	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	BOI2	P39969	1040 aa		19.65	■□□□□ 0.74
YOL085C	YOL085C	HKR1	P41809	1802 aa		19.63	■□□□□ 0.73
YOL085C	YOL085C	VPS4	P52917	437 aa		19.63	■□□□□ 0.73
YOL085C	YOL085C	GSM1	P42950	618 aa		19.62	■□□□□ 0.73
YOL085C	YOL085C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	19.62	■□□□□ 0.73
YOL085C	YOL085C	YGR117C	P53270	476 aa		19.61	■□□□□ 0.73
YOL085C	YOL085C	SRC1	Q03707	834 aa		19.61	■□□□□ 0.73
YOL085C	YOL085C	CRF1	Q04930	467 aa		19.6	■□□□□ 0.73
YOL085C	YOL085C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	19.58	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	19.58	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	STV1	P37296	890 aa		19.58	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	EMP47	P43555	445 aa		19.58	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	19.58	■□□□□ 0.72	not detected
YOL085C	YOL085C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	19.57	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	IRC4	Q03036	179 aa		19.57	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	FIG2	P25653	1609 aa		19.56	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	DAL5	P15365	543 aa		19.56	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	19.56	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	19.56	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	19.56	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	YIL092W	P40497	633 aa		19.55	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	TOS4	Q06266	489 aa		19.55	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	PEA2	P40091	420 aa		19.53	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	YIL089W	P40500	205 aa		19.53	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	19.52	■□□□□ 0.72
YOL085C	YOL085C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
YOL085C	YOL085C	FLO11	P08640	1367 aa		19.51	■□□□□ 0.71
YOL085C	YOL085C	ADR1	P07248	1323 aa		19.51	■□□□□ 0.71
YOL085C	YOL085C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
YOL085C	YOL085C	ARG82	P07250	355 aa		19.46	■□□□□ 0.71
YOL085C	YOL085C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
YOL085C	YOL085C	JJJ2	P46997	583 aa		19.46	■□□□□ 0.71
YOL085C	YOL085C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	19.45	■□□□□ 0.7

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