RNA–Protein interactions for RNA: YOL008W

COQ10, Transcript of Coenzyme Q (ubiquinone) binding protein, yeast

Gene COQ10, Length 624 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COQ10	YOL008W	LEU3	P08638	886 aa		5.53	□□□□□ -1.52
COQ10	YOL008W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
COQ10	YOL008W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
COQ10	YOL008W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
COQ10	YOL008W	BRL1	P38770	471 aa		5.52	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	ATG3	P40344	310 aa		5.52	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	SUM1	P46676	1062 aa		5.52	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	HPC2	Q01448	625 aa		5.52	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	TDA6	Q06466	467 aa		5.52	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	SOH1	P38633	127 aa		5.51	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.51	□□□□□ -1.53	not detected
COQ10	YOL008W	YMR187C	Q03236	431 aa		5.51	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	IRE1	P32361	1115 aa		5.5	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	SLX8	P40072	274 aa		5.5	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	JJJ2	P46997	583 aa		5.5	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	YNR014W	P53719	212 aa		5.5	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	HDA3	Q06623	655 aa		5.5	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	FPS1	P23900	669 aa		5.49	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	SKN7	P38889	622 aa		5.49	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	YPP1	P46951	817 aa		5.49	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	TFB3	Q03290	321 aa		5.47	□□□□□ -1.53
COQ10	YOL008W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	PKC1	P24583	1151 aa		5.46	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	MRPL16	P38064	232 aa		5.45	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	BIO2	P32451	375 aa		5.44	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	BOI2	P39969	1040 aa		5.44	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	YNL108C	P53929	270 aa		5.44	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.44	□□□□□ -1.54	not detected
COQ10	YOL008W	PSH1	Q12161	406 aa		5.44	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	STB3	Q12427	513 aa		5.43	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	MET1	P36150	593 aa		5.42	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	SWI5	P08153	709 aa		5.41	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	SPR3	P41901	512 aa		5.4	□□□□□ -1.54
COQ10	YOL008W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	YPQ2	Q06328	317 aa		5.39	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	YDR215C	Q12240	137 aa		5.38	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	YFL034W	P43564	1073 aa		5.37	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	RIM21	P48565	533 aa		5.37	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	TAT1	P38085	619 aa		5.36	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	YTA6	P40328	754 aa		5.36	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	YJL007C	P47080	104 aa		5.35	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	NTH2	P35172	780 aa		5.34	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	LSB6	P42951	607 aa		5.34	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	MCA1	Q08601	432 aa		5.34	□□□□□ -1.55
COQ10	YOL008W	MCM1	P11746	286 aa		5.33	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	ALD2	P47771	506 aa		5.33	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	YNL165W	P53891	406 aa		5.33	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	RGP1	P16664	663 aa		5.32	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	MSC7	P38694	644 aa		5.31	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	PRY1	P47032	299 aa		5.31	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	MLF3	P32047	452 aa		5.3	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	TSC13	Q99190	310 aa		5.3	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.3	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	HEH2	Q03281	663 aa		5.28	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	MRX10	Q05648	414 aa		5.28	□□□□□ -1.56
COQ10	YOL008W	YPL034W	Q03083	165 aa		5.27	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	NHA1	Q99271	985 aa		5.27	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	CYT1	P07143	309 aa		5.26	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	MAC1	P35192	417 aa		5.26	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	ALG14	P38242	237 aa		5.26	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	BIM1	P40013	344 aa		5.26	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	MTO1	P53070	669 aa		5.25	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	ATG32	P40458	529 aa		5.24	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	PRK1	P40494	810 aa		5.23	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	PEP12	P32854	288 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	BUD9	P53226	547 aa		5.22	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
COQ10	YOL008W	SKP1	P52286	194 aa		5.21	□□□□□ -1.58
COQ10	YOL008W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
COQ10	YOL008W	KAP122	P32767	1081 aa		5.2	□□□□□ -1.58
COQ10	YOL008W	KTR7	P40504	517 aa		5.2	□□□□□ -1.58

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