RNA–Protein interactions for RNA: YMR258C

ROY1, Transcript of GTPase inhibitor with similarity to F-box proteins, yeast

Gene ROY1, Length 1,662 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROY1	YMR258C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	SLA1	P32790	1244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	SUM1	P46676	1062 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	HPF1	Q05164	967 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	SWI5	P08153	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	YGR035C	P53222	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	TSC13	Q99190	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	JJJ2	P46997	583 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	UBP15	P50101	1230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	KTR7	P40504	517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ROY1	YMR258C	NTH2	P35172	780 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	CUZ1	P53899	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	TRK2	P28584	889 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	SIS2	P36024	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	IRE1	P32361	1115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	PHO87	P25360	923 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	TTI1	P36097	1038 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	LYS5	P50113	272 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	DPH6	Q12429	685 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	DIT1	P21623	536 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	TGL4	P36165	910 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	JJJ3	P47138	172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	YNL165W	P53891	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	CYT1	P07143	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	MCM1	P11746	286 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	GAL2	P13181	574 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	HAP4	P14064	554 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	PSH1	Q12161	406 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	CPS1	P27614	576 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	ROM1	P53046	1155 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	GAS4	Q08271	471 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ROY1	YMR258C	CEM1	P39525	442 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	UBP1	P25037	809 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	ECM23	Q02710	187 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	MLF3	P32047	452 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	MRPL16	P38064	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	ALD2	P47771	506 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	TAF7	Q05021	590 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	PUP1	P25043	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	UBX7	P38349	436 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	SPR3	P41901	512 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	STB3	Q12427	513 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	HXT5	P38695	592 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ROY1	YMR258C	VAN1	P23642	535 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	FPS1	P23900	669 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	YTA6	P40328	754 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	RGP1	P16664	663 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	SUV3	P32580	737 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	SCD5	P34758	872 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	MDJ1	P35191	511 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	YML083C	Q04526	418 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	CAB1	Q04430	367 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	MSC7	P38694	644 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	YFL066C	P43538	392 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	MTO1	P53070	669 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	RLF2	Q12495	606 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	TRS33	Q99394	268 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	AI1	P03875	834 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	THI72	Q08579	599 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	ICP55	P40051	511 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	CWH41	P53008	833 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	NSG2	P53898	299 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	SKP1	P52286	194 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	RPC31	P17890	251 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	KAP122	P32767	1081 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ROY1	YMR258C	YBR197C	P38306	217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROY1	YMR258C	QDR2	P40474	542 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ROY1	YMR258C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ROY1	YMR258C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ROY1	YMR258C	PHM7	Q12252	991 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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