RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	SUM1	P46676	1062 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YLR224W	YLR224W	MSN5	P52918	1224 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YLR224W	YLR224W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
YLR224W	YLR224W	SWI5	P08153	709 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YLR224W	YLR224W	PEP12	P32854	288 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YLR224W	YLR224W	MDJ1	P35191	511 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YLR224W	YLR224W	TBS1	P38114	1094 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YLR224W	YLR224W	MTC5	Q03897	1148 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YLR224W	YLR224W	YPR204W	Q08995	1032 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YLR224W	YLR224W	YPQ2	Q06328	317 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	KTR7	P40504	517 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	NTH2	P35172	780 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	UBP15	P50101	1230 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	YNL165W	P53891	406 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	IRE1	P32361	1115 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	ATG3	P40344	310 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	JJJ2	P46997	583 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	LYS5	P50113	272 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	JJJ3	P47138	172 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	PSH1	Q12161	406 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	DPH6	Q12429	685 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	DIT1	P21623	536 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	SYT1	Q06836	1226 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YLR224W	YLR224W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	CEM1	P39525	442 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	YFL066C	P43538	392 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	TSC13	Q99190	310 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	MRPL16	P38064	232 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	THI72	Q08579	599 aa		5.55	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	ALD2	P47771	506 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	TTI1	P36097	1038 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	ICP55	P40051	511 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
YLR224W	YLR224W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	CYT1	P07143	309 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	PHO87	P25360	923 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	MLF3	P32047	452 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	SPR3	P41901	512 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	ROM1	P53046	1155 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	STB3	Q12427	513 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	YFL034W	P43564	1073 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	TGL4	P36165	910 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	NSG2	P53898	299 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	TAF7	Q05021	590 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	MCM1	P11746	286 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	GAL2	P13181	574 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	CPS1	P27614	576 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	ECM23	Q02710	187 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	PHM7	Q12252	991 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	AI1	P03875	834 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	SUV3	P32580	737 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	MSC7	P38694	644 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	HXT5	P38695	592 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YLR224W	YLR224W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	FPS1	P23900	669 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	HAP4	P14064	554 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	RGP1	P16664	663 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	PUP1	P25043	261 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.44	□□□□□ -1.54	not detected
YLR224W	YLR224W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	TDA6	Q06466	467 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	YNR040W	P53736	256 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	GAS4	Q08271	471 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	UBP1	P25037	809 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	MTO1	P53070	669 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	YML083C	Q04526	418 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	UBX7	P38349	436 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	YTA6	P40328	754 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	RLF2	Q12495	606 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YLR224W	YLR224W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YLR224W	YLR224W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YLR224W	YLR224W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YLR224W	YLR224W	CAB1	Q04430	367 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YLR224W	YLR224W	MRP10	O75012	95 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YLR224W	YLR224W	KAP122	P32767	1081 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YLR224W	YLR224W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YLR224W	YLR224W	VAN1	P23642	535 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YLR224W	YLR224W	SIS2	P36024	562 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YLR224W	YLR224W	QDR2	P40474	542 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YLR224W	YLR224W	PRK1	P40494	810 aa		5.37	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.2 ms