RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	PUP1	P25043	261 aa		6.96	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	YJR098C	P47139	656 aa		6.96	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	UBP2	Q01476	1272 aa		6.96	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	OPT2	Q06593	877 aa		6.96	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	GAS4	Q08271	471 aa		6.95	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	TCB1	Q12466	1186 aa		6.95	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	SUM1	P46676	1062 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	SCW11	P53189	542 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	CYT1	P07143	309 aa		6.92	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	VAN1	P23642	535 aa		6.92	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	YML083C	Q04526	418 aa		6.92	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	ROM1	P53046	1155 aa		6.91	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
YKR070W	YKR070W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	MSN5	P52918	1224 aa		6.89	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	SSN3	P39073	555 aa		6.88	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	CWH41	P53008	833 aa		6.88	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	TRS33	Q99394	268 aa		6.88	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	DAL1	P32375	460 aa		6.87	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	OSH7	P38755	437 aa		6.86	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	VTC4	P47075	721 aa		6.86	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		6.86	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	PUN1	Q06991	263 aa		6.85	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	UBP1	P25037	809 aa		6.84	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	JJJ2	P46997	583 aa		6.84	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	YPQ2	Q06328	317 aa		6.84	□□□□□ -1.31
YKR070W	YKR070W	MCM1	P11746	286 aa		6.83	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	6.83	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	CAF120	P53836	1060 aa		6.83	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	IRE1	P32361	1115 aa		6.82	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	RGA1	P39083	1007 aa		6.82	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	YTA6	P40328	754 aa		6.82	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		6.81	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	6.8	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	SLA1	P32790	1244 aa		6.8	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	GEF1	P37020	779 aa		6.8	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	UBP15	P50101	1230 aa		6.8	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		6.79	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	SRS2	P12954	1174 aa		6.78	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	ACO2	P39533	789 aa		6.78	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	YIR007W	P40566	764 aa		6.78	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	ROG3	P43602	733 aa		6.78	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	6.78	□□□□□ -1.32
YKR070W	YKR070W	MLF3	P32047	452 aa		6.77	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	SCD5	P34758	872 aa		6.77	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	6.77	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	6.77	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	PNP1	Q05788	311 aa		6.77	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	YNL165W	P53891	406 aa		6.76	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		6.76	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	SUV3	P32580	737 aa		6.75	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	RRN6	P32786	894 aa		6.75	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	PSH1	Q12161	406 aa		6.74	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	HXT5	P38695	592 aa		6.73	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	MTO1	P53070	669 aa		6.73	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	YDL176W	Q12027	708 aa		6.73	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	ISC10	P32645	267 aa		6.72	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	YBR197C	P38306	217 aa		6.72	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	CAB1	Q04430	367 aa		6.72	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
YKR070W	YKR070W	MRPL16	P38064	232 aa		6.71	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	CUZ1	P53899	274 aa		6.71	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	KAR5	Q04746	504 aa		6.71	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	STB3	Q12427	513 aa		6.71	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	DIT1	P21623	536 aa		6.7	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	MRPL33	P20084	86 aa		6.69	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	CEM1	P39525	442 aa		6.69	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	KAP122	P32767	1081 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	QDR2	P40474	542 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	YPL062W	Q02781	134 aa		6.68	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	RGP1	P16664	663 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	VMA3	P25515	160 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	YGR035C	P53222	116 aa		6.67	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	CCP1	P00431	361 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	FPS1	P23900	669 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	LDH1	P38139	375 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	DYS1	P38791	387 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	ALD2	P47771	506 aa		6.66	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	HPF1	Q05164	967 aa		6.65	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	HAT1	Q12341	374 aa		6.65	□□□□□ -1.34
YKR070W	YKR070W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	BOL3	P39724	118 aa		6.64	□□□□□ -1.35
YKR070W	YKR070W	LYS5	P50113	272 aa		6.64	□□□□□ -1.35

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 1119 ms