RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W LSO1Q3E827 93 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W SEC8P32855 1065 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W MGE1P38523 228 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W SVF1Q05515 481 aa6.78□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W GYP1Q08484 637 aa6.78□□□□□ -1.32
YKR047WYKR047W APP1P53933 587 aa6.77□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W SWI5P08153 709 aa6.76□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W MET4P32389 672 aa6.76□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W UTR2P32623 467 aa6.76□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W NGR1P32831 672 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W BOI1P38041 980 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W PRE3P38624 215 aa6.76□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W SPR3P41901 512 aa6.76□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W SAS4Q04003 481 aa6.76□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W EMW1P42842 904 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W YJR107WP47145 328 aa6.75□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W BMT6Q12291 365 aa6.75□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W STB3Q12427 513 aa6.75□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W DAT1P13483 248 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W ISC10P32645 267 aa6.74□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W YBR197CP38306 217 aa6.74□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W TRS120Q04183 1289 aa6.74□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W YTA7P40340 1379 aa6.73□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W MET1P36150 593 aa6.73□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W TBS1P38114 1094 aa6.73□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W ISU1Q03020 165 aa6.73□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W PUS5Q06244 254 aa6.73□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W MKS1P34072 584 aa6.72□□□□□ -1.33
YKR047WYKR047W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W FBP26P32604 452 aa6.71□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W OCA5P38738 679 aa6.71□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W RPB10P22139 70 aa6.7□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W CAB1Q04430 367 aa6.7□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W NAP1P25293 417 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W FYV10P40492 516 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W BDP1P46678 594 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W NNF1P47149 201 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W UFD2P54860 961 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W GPI13Q07830 1017 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W APC11Q12157 165 aa6.68□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W WTM2Q12206 467 aa6.68□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W PHO4P07270 312 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W RPT1P33299 467 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W MCM2P29469 868 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W SUT1P53032 299 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W DFG5Q05031 458 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W BDS1Q08347 646 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W MNL2Q12205 849 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W STE6P12866 1290 aa6.65□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
YKR047WYKR047W MRPL33P20084 86 aa6.64□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W GCD6P32501 712 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W HXT5P38695 592 aa6.64□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W UTP7P40055 554 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W SPR28Q04921 423 aa6.64□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W MCM1P11746 286 aa6.63□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W CST6P40535 587 aa6.63□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W YPQ2Q06328 317 aa6.63□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W SDH2P21801 266 aa6.62□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W PEP7P32609 515 aa6.62□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W SCD5P34758 872 aa6.62□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W YBL086CP38177 466 aa6.62□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W DAK2P43550 591 aa6.62□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W YNL011CP53980 444 aa6.62□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W KTR2P33550 425 aa6.61□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W DLD3P39976 496 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W MAD1P40957 749 aa6.61□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W SAM37P50110 327 aa6.61□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W CDC55Q00362 526 aa6.61□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W IOC4Q04213 475 aa6.61□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W SMC1P32908 1225 aa6.6□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W VPS35P34110 944 aa6.6□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W VAC8P39968 578 aa6.6□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W SUM1P46676 1062 aa6.6□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W VMA3P25515 160 aa6.59□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W RPS26AP39938 119 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W RPS26BP39939 119 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W HXT8P40886 569 aa6.59□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W ALD6P54115 500 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W RMD1Q03441 430 aa6.59□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W OXR1Q08952 273 aa6.59□□□□□ -1.35
YKR047WYKR047W BRN1P38170 754 aa6.58□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W YOL098CQ12496 1037 aa6.58□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W CLN2P20438 545 aa6.57□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W LDH1P38139 375 aa6.57□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W CIC1P38779 376 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W ALD3P54114 506 aa6.57□□□□□ -1.36
YKR047WYKR047W VPS16Q03308 798 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.3 ms