RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A MCM16Q12262 181 aa6.89□□□□□ -1.31
YHL009W-AYHL009W-A APL6P46682 809 aa6.87□□□□□ -1.31
YHL009W-AYHL009W-A SPT5P27692 1063 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
YHL009W-AYHL009W-A YBL036CP38197 257 aa6.86□□□□□ -1.31
YHL009W-AYHL009W-A HAL5P38970 855 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
YHL009W-AYHL009W-A YNR014WP53719 212 aa6.86□□□□□ -1.31
YHL009W-AYHL009W-A YDJ1P25491 409 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
YHL009W-AYHL009W-A MCX1P38323 520 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
YHL009W-AYHL009W-A SUM1P46676 1062 aa6.85□□□□□ -1.31
YHL009W-AYHL009W-A FPS1P23900 669 aa6.83□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A IRE1P32361 1115 aa6.83□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A JJJ2P46997 583 aa6.83□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A YCK2P23292 546 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A SOH1P38633 127 aa6.81□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A GPM1P00950 247 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A SLX8P40072 274 aa6.8□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A ATG3P40344 310 aa6.8□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A HDA3Q06623 655 aa6.8□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A MRPL16P38064 232 aa6.79□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A BRL1P38770 471 aa6.79□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A BOI2P39969 1040 aa6.79□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
YHL009W-AYHL009W-A SHM1P37292 490 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A HPC2Q01448 625 aa6.77□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A YDR215CQ12240 137 aa6.77□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A AMN1P38285 549 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A YPP1P46951 817 aa6.76□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A STB3Q12427 513 aa6.75□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A PDC6P26263 563 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A MET1P36150 593 aa6.74□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A RPN1P38764 993 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A PSH1Q12161 406 aa6.74□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A LEU3P08638 886 aa6.73□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A TFB3Q03290 321 aa6.73□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data6.73□□□□□ -1.33not detected
YHL009W-AYHL009W-A GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
YHL009W-AYHL009W-A PKC1P24583 1151 aa6.71□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A PDC5P16467 563 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A KNS1P32350 737 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A SPR3P41901 512 aa6.7□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A YNL108CP53929 270 aa6.7□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A SWI5P08153 709 aa6.69□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A BIO2P32451 375 aa6.69□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A ENO2P00925 437 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A RPS31P05759 152 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A SUP45P12385 437 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A TAT1P38085 619 aa6.68□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A LSB6P42951 607 aa6.68□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A MCA1Q08601 432 aa6.68□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A YPQ2Q06328 317 aa6.67□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A AIM9P40053 627 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
YHL009W-AYHL009W-A LEU1P07264 779 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A MAC1P35192 417 aa6.63□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A PRY1P47032 299 aa6.63□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A YTA6P40328 754 aa6.62□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A IRC24P40580 263 aa6.61□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A YFL034WP43564 1073 aa6.61□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A RIM21P48565 533 aa6.61□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A RGP1P16664 663 aa6.6□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A NTH2P35172 780 aa6.6□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A ALD2P47771 506 aa6.6□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A YNL165WP53891 406 aa6.6□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A RDS2P19541 446 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A MSC7P38694 644 aa6.59□□□□□ -1.35
YHL009W-AYHL009W-A MCM1P11746 286 aa6.57□□□□□ -1.36
YHL009W-AYHL009W-A YJL007CP47080 104 aa6.57□□□□□ -1.36
YHL009W-AYHL009W-A YPL034WQ03083 165 aa6.57□□□□□ -1.36
YHL009W-AYHL009W-A Q0182Q9ZZW1 134 aa6.57□□□□□ -1.36
YHL009W-AYHL009W-A PDI1P17967 522 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
YHL009W-AYHL009W-A MLF3P32047 452 aa6.56□□□□□ -1.36
YHL009W-AYHL009W-A INP52P50942 1183 aa6.55□□□□□ -1.36
YHL009W-AYHL009W-A NHA1Q99271 985 aa6.55□□□□□ -1.36
YHL009W-AYHL009W-A TPS3P38426 1054 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
YHL009W-AYHL009W-A PGM2P37012 569 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
YHL009W-AYHL009W-A ALG14P38242 237 aa6.53□□□□□ -1.36
YHL009W-AYHL009W-A MTO1P53070 669 aa6.52□□□□□ -1.37
YHL009W-AYHL009W-A ALO1P54783 526 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
YHL009W-AYHL009W-A HEH2Q03281 663 aa6.52□□□□□ -1.37
YHL009W-AYHL009W-A TSC13Q99190 310 aa6.52□□□□□ -1.37
YHL009W-AYHL009W-A BUD9P53226 547 aa6.5□□□□□ -1.37
YHL009W-AYHL009W-A ENO1P00924 437 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
YHL009W-AYHL009W-A CYT1P07143 309 aa6.49□□□□□ -1.37
YHL009W-AYHL009W-A MRX10Q05648 414 aa6.49□□□□□ -1.37
YHL009W-AYHL009W-A OMA1P36163 345 aa6.48□□□□□ -1.37
YHL009W-AYHL009W-A PRK1P40494 810 aa6.48□□□□□ -1.37
YHL009W-AYHL009W-A NCL1P38205 684 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
YHL009W-AYHL009W-A RTG2P32608 588 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A NAR1P23503 491 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A BIM1P40013 344 aa6.45□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A TIF1P10081 395 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data6.43□□□□□ -1.38not detected
YHL009W-AYHL009W-A ATG32P40458 529 aa6.43□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A RPL34BP40525 121 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A SKP1P52286 194 aa6.43□□□□□ -1.38
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