RNA–Protein interactions for RNA: YDL063C

SYO1, Transcript of Transport adaptor or symportin, yeast

Gene SYO1, Length 1,863 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYO1	YDL063C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	KIP2	P28743	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	YBR197C	P38306	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	VAN1	P23642	535 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	MET4	P32389	672 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	FBP26	P32604	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	CYT1	P07143	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	YPQ2	Q06328	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	MNL2	Q12205	849 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	STB3	Q12427	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	STE6	P12866	1290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	RPB10	P22139	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	BCK2	P33306	851 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	YBL086C	P38177	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	HXT5	P38695	592 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	PPX1	P38698	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	DFG5	Q05031	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	UTR2	P32623	467 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	ISC10	P32645	267 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	MKS1	P34072	584 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	YNL165W	P53891	406 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	APC11	Q12157	165 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	WTM2	Q12206	467 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	TRS33	Q99394	268 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SYO1	YDL063C	POL32	P47110	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	ACF4	P47129	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	MET32	Q12041	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	SEC20	P28791	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	RAS1	P01119	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	TOS4	Q06266	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	SEC8	P32855	1065 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	FYV10	P40492	516 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	THI12	P42883	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	THI5	P43534	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	YJR107W	P47145	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	THI11	P47183	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	THI13	Q07748	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	MRPL33	P20084	86 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	AMS1	P22855	1083 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
SYO1	YDL063C	SUM1	P46676	1062 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	HED1	Q03937	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYO1	YDL063C	SSN3	P39073	555 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	MCM2	P29469	868 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	MET1	P36150	593 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	DAK2	P43550	591 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	SPR28	Q04921	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	VMA3	P25515	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	BDS1	Q08347	646 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	MCM1	P11746	286 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	MET10	P39692	1035 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	CWH41	P53008	833 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	MLF3	P32047	452 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	TBS1	P38114	1094 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	XDJ1	P39102	459 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	SLA1	P32790	1244 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	RGD2	P43556	714 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	ASF1	P32447	279 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	SPR3	P41901	512 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SYO1	YDL063C	AAD14	P42884	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	MSN1	P22148	382 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	SCD5	P34758	872 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	QDR2	P40474	542 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	HXT8	P40886	569 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	JJJ2	P46997	583 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	COB	P00163	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	DLD1	P32891	587 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	ASH1	P34233	588 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	BSD2	P38356	321 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	OCA5	P38738	679 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	YNL011C	P53980	444 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	UFD2	P54860	961 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	CTR9	P89105	1077 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	RSC4	Q02206	625 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SYO1	YDL063C	RPC31	P17890	251 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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