RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637578.1

CLN3-260, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 2

Gene CLN3, Length 1,577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-260ENST00000637578 TRIM52Q96A61 297 aa28.91■■■□□ 2.22
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CLN3-260ENST00000637578 KCNA6P17658 529 aa28.87■■■□□ 2.21
CLN3-260ENST00000637578 TRPM2O94759 1503 aa28.85■■■□□ 2.21
CLN3-260ENST00000637578 TOM1O60784 492 aa28.85■■■□□ 2.21
CLN3-260ENST00000637578 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
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CLN3-260ENST00000637578 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.12■■■□□ 2.09
CLN3-260ENST00000637578 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.12■■■□□ 2.09
CLN3-260ENST00000637578 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.09■■■□□ 2.09
CLN3-260ENST00000637578 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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