RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 JPH4Q96JJ6 628 aa12.95□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 STK25O00506 426 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 CCER2I3L3R5 266 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 ANP32CO43423 234 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa12.93□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 NLRP6P59044 892 aa12.92□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCC10Q5T3U5 1492 aa12.91□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHD1A6NEE1 506 aa12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF5Q12774 1597 aa12.9□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 MMRN1Q13201 1228 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 DOK7Q18PE1 504 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 NCOA1Q15788 1441 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP10BO94823 1461 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX14Q8IWB6 1497 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 SHROOM2Q13796 1616 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 CHD1O14646 1710 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPRGP23470 1445 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 KDM5DQ9BY66 1539 aa12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf84Q5VXU9 1444 aa12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 PZPP20742 1482 aa12.85□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 PREX2Q70Z35 1606 aa12.85□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-222ENST00000592408 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR153Q6NV75 609 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 BCANQ96GW7 911 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC141Q6ZP82 1450 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 ERBB3P21860 1342 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 MBD5Q9P267 1494 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCC2Q92887 1545 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R37O75864 691 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPY4P0CV99 314 aa12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPY10P0CW01 314 aa12.79□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa12.77□□□□□ -0.36
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf72A6NCS6 295 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF3CO14782 793 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 ARSIQ5FYB1 569 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF15Q9NS87 1388 aa12.77□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 MYO5CQ9NQX4 1742 aa12.76□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 RIMBP2O15034 1052 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 PLXNC1O60486 1568 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC7Q96M83 1385 aa12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 WASHC2AQ641Q2 1341 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 NEFLP07196 543 aa12.74□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 UNC13BO14795 1591 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC37Q6PGP7 1564 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 RALGAPBQ86X10 1494 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 NUP155O75694 1391 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 SYCP2Q9BX26 1530 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 VSIG10Q8N0Z9 540 aa12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNH8Q96L42 1107 aa12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-222ENST00000592408 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP12.71□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 DUOX2Q9NRD8 1548 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF8Q3BBV2 869 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 KDM5CP41229 1560 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 USP47Q96K76 1375 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 ARAP3Q8WWN8 1544 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 ERBINQ96RT1 1412 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 IQGAP3Q86VI3 1631 aa12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-222ENST00000592408 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.5 ms