RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ATP10AO60312 1499 aa20.02■□□□□ 0.8
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CTIF-205ENST00000587860 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.02■□□□□ 0.8
CTIF-205ENST00000587860 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.02■□□□□ 0.79
CTIF-205ENST00000587860 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-205ENST00000587860 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CTIF-205ENST00000587860 PLXNC1O60486 1568 aa20.01■□□□□ 0.79
CTIF-205ENST00000587860 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
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CTIF-205ENST00000587860 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
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CTIF-205ENST00000587860 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.94■□□□□ 0.78
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CTIF-205ENST00000587860 CARD14Q9BXL6 1004 aa19.91■□□□□ 0.78
CTIF-205ENST00000587860 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.91■□□□□ 0.78
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CTIF-205ENST00000587860 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.89■□□□□ 0.77
CTIF-205ENST00000587860 STK26Q9P289 416 aa19.88■□□□□ 0.77
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CTIF-205ENST00000587860 APAF1O14727 1248 aa19.86■□□□□ 0.77
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CTIF-205ENST00000587860 CD109Q6YHK3 1445 aa19.85■□□□□ 0.77
CTIF-205ENST00000587860 MADDQ8WXG6 1647 aa19.85■□□□□ 0.77
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CTIF-205ENST00000587860 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
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CTIF-205ENST00000587860 TET3O43151 1660 aa19.74■□□□□ 0.75
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CTIF-205ENST00000587860 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.72■□□□□ 0.75
CTIF-205ENST00000587860 CEP152O94986 1710 aa19.72■□□□□ 0.75
CTIF-205ENST00000587860 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
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CTIF-205ENST00000587860 VWDEQ8N2E2 1590 aa19.67■□□□□ 0.74
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CTIF-205ENST00000587860 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.65■□□□□ 0.74
CTIF-205ENST00000587860 PDE4AP27815 886 aa19.65■□□□□ 0.74
CTIF-205ENST00000587860 RGS3P49796 1198 aa19.65■□□□□ 0.74
CTIF-205ENST00000587860 STAC3Q96MF2 364 aa19.65■□□□□ 0.74
CTIF-205ENST00000587860 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa19.65■□□□□ 0.74
CTIF-205ENST00000587860 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.64■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
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