RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564891.1

KIFC3-218, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 5

Gene KIFC3, Length 424 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-218ENST00000564891 BCANQ96GW7 911 aa35.29■■■■□ 3.24
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KIFC3-218ENST00000564891 TRIM52Q96A61 297 aa35.27■■■■□ 3.24
KIFC3-218ENST00000564891 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
KIFC3-218ENST00000564891 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.23■■■■□ 3.23
KIFC3-218ENST00000564891 PIP4K2BP78356 416 aa35.23■■■■□ 3.23
KIFC3-218ENST00000564891 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
KIFC3-218ENST00000564891 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.23■■■■□ 3.23
KIFC3-218ENST00000564891 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
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KIFC3-218ENST00000564891 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
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KIFC3-218ENST00000564891 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.91■■■■□ 3.18
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KIFC3-218ENST00000564891 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.81■■■■□ 3.16
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KIFC3-218ENST00000564891 C14orf37Q86TY3 774 aa34.81■■■■□ 3.16
KIFC3-218ENST00000564891 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.81■■■■□ 3.16
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KIFC3-218ENST00000564891 PTCH1Q13635 1447 aa34.52■■■■□ 3.12
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KIFC3-218ENST00000564891 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.31■■■■□ 3.08
KIFC3-218ENST00000564891 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
KIFC3-218ENST00000564891 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
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KIFC3-218ENST00000564891 LAMC1P11047 1609 aa34.26■■■■□ 3.07
KIFC3-218ENST00000564891 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.26■■■■□ 3.07
KIFC3-218ENST00000564891 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.25■■■■□ 3.07
KIFC3-218ENST00000564891 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
KIFC3-218ENST00000564891 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.25■■■■□ 3.07
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