RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-231ENST00000552222 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-231ENST00000552222 C14orf37Q86TY3 774 aa21.73■■□□□ 1.07
CS-231ENST00000552222 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.72■■□□□ 1.07
CS-231ENST00000552222 ABCC5O15440 1437 aa21.72■■□□□ 1.07
CS-231ENST00000552222 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CS-231ENST00000552222 AFF2P51816 1311 aa21.7■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 ADGRB3O60242 1522 aa21.7■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 NOS1P29475 1434 aa21.68■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.68■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.68■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 ERBINQ96RT1 1412 aa21.68■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 RGS12O14924 1447 aa21.66■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 BRINP3Q76B58 766 aa21.66■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 ZFYVE9O95405 1425 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 KANK1Q14678 1352 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 SHPRHQ149N8 1683 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 DIP2AQ14689 1571 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.64■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
CS-231ENST00000552222 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 C8orf37Q96NL8 207 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 ATF3P18847 181 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 DAPK1P53355 1430 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 TBX22Q9Y458 520 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-231ENST00000552222 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-231ENST00000552222 PTPRUQ92729 1446 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-231ENST00000552222 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-231ENST00000552222 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-231ENST00000552222 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-231ENST00000552222 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-231ENST00000552222 ADAMTS2O95450 1211 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-231ENST00000552222 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-231ENST00000552222 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CS-231ENST00000552222 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-231ENST00000552222 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-231ENST00000552222 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-231ENST00000552222 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-231ENST00000552222 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-231ENST00000552222 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.48■■□□□ 1.03
CS-231ENST00000552222 MST1RQ04912 1400 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-231ENST00000552222 NGLY1Q96IV0 654 aa21.47■■□□□ 1.03
CS-231ENST00000552222 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CS-231ENST00000552222 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CS-231ENST00000552222 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-231ENST00000552222 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-231ENST00000552222 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
CS-231ENST00000552222 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-231ENST00000552222 USP21Q9UK80 565 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-231ENST00000552222 TRPM2O94759 1503 aa21.39■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 METP08581 1390 aa21.38■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 PIK3R4Q99570 1358 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 UNC13BO14795 1591 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 ORAI2Q96SN7 254 aa21.35■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.35■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 DCCP43146 1447 aa21.34■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 E9PCH4 1651 aa21.34■■□□□ 1.01
CS-231ENST00000552222 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CS-231ENST00000552222 ADGRL2O95490 1459 aa21.32■■□□□ 1
CS-231ENST00000552222 EP400Q96L91 3159 aa21.31■■□□□ 1
CS-231ENST00000552222 ATRNO75882 1429 aa21.29■■□□□ 1
CS-231ENST00000552222 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.29■■□□□ 1
CS-231ENST00000552222 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.29■■□□□ 1
CS-231ENST00000552222 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.28■■□□□ 1
CS-231ENST00000552222 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CS-231ENST00000552222 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.28■■□□□ 1
CS-231ENST00000552222 APLP2Q06481 763 aa21.27■■□□□ 1
CS-231ENST00000552222 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CS-231ENST00000552222 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CS-231ENST00000552222 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CS-231ENST00000552222 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.24■□□□□ 0.99
CS-231ENST00000552222 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CS-231ENST00000552222 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CS-231ENST00000552222 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.19■□□□□ 0.98
CS-231ENST00000552222 PTCH1Q13635 1447 aa21.18■□□□□ 0.98
CS-231ENST00000552222 NUP155O75694 1391 aa21.17■□□□□ 0.98
CS-231ENST00000552222 CCDC125Q86Z20 511 aa21.16■□□□□ 0.98
CS-231ENST00000552222 MYOM2P54296 1465 aa21.15■□□□□ 0.98
CS-231ENST00000552222 FOXD1Q16676 465 aa21.15■□□□□ 0.98
CS-231ENST00000552222 LAMC1P11047 1609 aa21.15■□□□□ 0.98
CS-231ENST00000552222 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.15■□□□□ 0.98
CS-231ENST00000552222 PLEKHG5O94827 1062 aa21.14■□□□□ 0.97
CS-231ENST00000552222 NUTM2FA1L443 756 aa21.13■□□□□ 0.97
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