RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 DAPK1P53355 1430 aa18.74■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.74■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa18.74■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.73■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-228ENST00000551473 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.71■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 APLP2Q06481 763 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 C14orf37Q86TY3 774 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP18.67■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 TBX22Q9Y458 520 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 ZFYVE9O95405 1425 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-228ENST00000551473 ATF3P18847 181 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 LRP6O75581 1613 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 TRIM52Q96A61 297 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 RXRBP28702 533 aa18.62■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 PIK3R4Q99570 1358 aa18.62■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 DIP2AQ14689 1571 aa18.59■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 ADGRL2O95490 1459 aa18.59■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 SHPRHQ149N8 1683 aa18.59■□□□□ 0.57
CS-228ENST00000551473 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 DCCP43146 1447 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 BRINP3Q76B58 766 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 TRPM2O94759 1503 aa18.52■□□□□ 0.56
CS-228ENST00000551473 AFF2P51816 1311 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-228ENST00000551473 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-228ENST00000551473 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.51■□□□□ 0.55
CS-228ENST00000551473 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.5■□□□□ 0.55
CS-228ENST00000551473 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CS-228ENST00000551473 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CS-228ENST00000551473 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CS-228ENST00000551473 FOXD1Q16676 465 aa18.47■□□□□ 0.55
CS-228ENST00000551473 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CS-228ENST00000551473 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa18.47■□□□□ 0.55
CS-228ENST00000551473 UNC13BO14795 1591 aa18.45■□□□□ 0.54
CS-228ENST00000551473 C8orf37Q96NL8 207 aa18.44■□□□□ 0.54
CS-228ENST00000551473 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CS-228ENST00000551473 MST1RQ04912 1400 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-228ENST00000551473 PTPRUQ92729 1446 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-228ENST00000551473 NGLY1Q96IV0 654 aa18.43■□□□□ 0.54
CS-228ENST00000551473 RGS12O14924 1447 aa18.42■□□□□ 0.54
CS-228ENST00000551473 NHSL1Q5SYE7 1610 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-228ENST00000551473 PNPLA6Q8IY17 1366 aa18.41■□□□□ 0.54
CS-228ENST00000551473 E9PCH4 1651 aa18.4■□□□□ 0.54
CS-228ENST00000551473 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.39■□□□□ 0.53
CS-228ENST00000551473 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-228ENST00000551473 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CS-228ENST00000551473 ROCK1Q13464 1354 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-228ENST00000551473 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-228ENST00000551473 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.38■□□□□ 0.53
CS-228ENST00000551473 NUP155O75694 1391 aa18.36■□□□□ 0.53
CS-228ENST00000551473 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CS-228ENST00000551473 ADAMTS2O95450 1211 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 METP08581 1390 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 USP21Q9UK80 565 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 PTCH1Q13635 1447 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 C1orf167Q5SNV9 1468 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 CCDC125Q86Z20 511 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CS-228ENST00000551473 LAMC1P11047 1609 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-228ENST00000551473 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-228ENST00000551473 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-228ENST00000551473 ATRNO75882 1429 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-228ENST00000551473 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-228ENST00000551473 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CS-228ENST00000551473 ORAI2Q96SN7 254 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-228ENST00000551473 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-228ENST00000551473 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.2■□□□□ 0.5
CS-228ENST00000551473 HFM1A2PYH4 1435 aa18.19■□□□□ 0.5
CS-228ENST00000551473 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CS-228ENST00000551473 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.17■□□□□ 0.5
CS-228ENST00000551473 ITGAEP38570 1179 aa18.17■□□□□ 0.5
CS-228ENST00000551473 MYOM2P54296 1465 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 414.7 ms