RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 NAIPQ13075 1403 aa14.15□□□□□ -0.14
CS-218ENST00000550159 MSH6P52701 1360 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 ERVK-7P63135 1459 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 PHLPP1O60346 1717 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 FOXD1Q16676 465 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 NUP155O75694 1391 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 SLIT1O75093 1534 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 ABCC3O15438 1527 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 AFF2P51816 1311 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-218ENST00000550159 BCANQ96GW7 911 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-218ENST00000550159 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-218ENST00000550159 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-218ENST00000550159 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-218ENST00000550159 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-218ENST00000550159 C14orf37Q86TY3 774 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-218ENST00000550159 RGS12O14924 1447 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-218ENST00000550159 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
CS-218ENST00000550159 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 C8orf37Q96NL8 207 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.02□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 UNC13BO14795 1591 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 NGLY1Q96IV0 654 aa14□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 TET3O43151 1660 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 ATF3P18847 181 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 IDI1Q13907 227 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 SHPRHQ149N8 1683 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 NWD1Q149M9 1564 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 C19orf44Q9H6X5 657 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
CS-218ENST00000550159 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.96□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 PIK3C2BO00750 1634 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 BRINP3Q76B58 766 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 CCDC125Q86Z20 511 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 CLSPNQ9HAW4 1339 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 CEP152O94986 1710 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 ADAMTS2O95450 1211 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 CCDC144AA2RUR9 1427 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 EP400Q96L91 3159 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 DIP2AQ14689 1571 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-218ENST00000550159 USP21Q9UK80 565 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-218ENST00000550159 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
CS-218ENST00000550159 TBX22Q9Y458 520 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-218ENST00000550159 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.87□□□□□ -0.19
CS-218ENST00000550159 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
CS-218ENST00000550159 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
CS-218ENST00000550159 PNPLA6Q8IY17 1366 aa13.85□□□□□ -0.19
CS-218ENST00000550159 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
CS-218ENST00000550159 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
CS-218ENST00000550159 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
CS-218ENST00000550159 E9PCH4 1651 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-218ENST00000550159 NEUROD1Q13562 356 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 ADGRB3O60242 1522 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 TRPM2O94759 1503 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 STAC3Q96MF2 364 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 TONSLQ96HA7 1378 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 NOS1P29475 1434 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 DEFB132Q7Z7B7 95 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 ZFYVE9O95405 1425 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.8□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa13.79□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 RGL3Q3MIN7 710 aa13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms