RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.64■■■■□ 3.3
SH3BP2-221ENST00000511747 C20orf194Q5TEA3 1177 aa35.64■■■■□ 3.3
SH3BP2-221ENST00000511747 IQGAP1P46940 1657 aa35.63■■■■□ 3.29
SH3BP2-221ENST00000511747 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.63■■■■□ 3.29
SH3BP2-221ENST00000511747 DUSP27Q5VZP5 1158 aa35.62■■■■□ 3.29
SH3BP2-221ENST00000511747 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.62■■■■□ 3.29
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF521Q96K83 1311 aa35.59■■■■□ 3.29
SH3BP2-221ENST00000511747 GOLGA2Q08379 1002 aa35.57■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 SYNMO15061 1565 aa35.57■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 SKAP1Q86WV1 359 aa35.57■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.55■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.55■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.55■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 CLTCL1P53675 1640 aa35.53■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 CEP152O94986 1710 aa35.53■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa35.52■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 PIK3C2GO75747 1445 aa35.52■■■■□ 3.28
SH3BP2-221ENST00000511747 KANK1Q14678 1352 aa35.5■■■■□ 3.27
SH3BP2-221ENST00000511747 KIF3BO15066 747 aa35.48■■■■□ 3.27
SH3BP2-221ENST00000511747 KDM2BQ8NHM5 1336 aa35.48■■■■□ 3.27
SH3BP2-221ENST00000511747 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.48■■■■□ 3.27
SH3BP2-221ENST00000511747 SLFN5Q08AF3 891 aa35.46■■■■□ 3.27
SH3BP2-221ENST00000511747 DEPDC5O75140 1603 aa35.46■■■■□ 3.27
SH3BP2-221ENST00000511747 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.45■■■■□ 3.27
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC146Q8IYE0 955 aa35.44■■■■□ 3.26
SH3BP2-221ENST00000511747 TET3O43151 1660 aa35.44■■■■□ 3.26
SH3BP2-221ENST00000511747 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
SH3BP2-221ENST00000511747 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC24A1O60721 1099 aa35.42■■■■□ 3.26
SH3BP2-221ENST00000511747 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
SH3BP2-221ENST00000511747 MYOM1P52179 1685 aa35.4■■■■□ 3.26
SH3BP2-221ENST00000511747 APAF1O14727 1248 aa35.39■■■■□ 3.26
SH3BP2-221ENST00000511747 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.38■■■■□ 3.25
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP7AQ04656 1500 aa35.38■■■■□ 3.25
SH3BP2-221ENST00000511747 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.38■■■■□ 3.25
SH3BP2-221ENST00000511747 FANCAO15360 1455 aa35.37■■■■□ 3.25
SH3BP2-221ENST00000511747 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
SH3BP2-221ENST00000511747 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.36■■■■□ 3.25
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.35■■■■□ 3.25
SH3BP2-221ENST00000511747 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
SH3BP2-221ENST00000511747 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
SH3BP2-221ENST00000511747 ERVK-7P63135 1459 aa35.32■■■■□ 3.25
SH3BP2-221ENST00000511747 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.32■■■■□ 3.24
SH3BP2-221ENST00000511747 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
SH3BP2-221ENST00000511747 OSCARQ8IYS5 282 aa35.3■■■■□ 3.24
SH3BP2-221ENST00000511747 DDRGK1Q96HY6 314 aa35.3■■■■□ 3.24
SH3BP2-221ENST00000511747 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.3■■■■□ 3.24
SH3BP2-221ENST00000511747 MYOM2P54296 1465 aa35.29■■■■□ 3.24
SH3BP2-221ENST00000511747 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.28■■■■□ 3.24
SH3BP2-221ENST00000511747 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
SH3BP2-221ENST00000511747 E9PSI1 815 aa35.27■■■■□ 3.24
SH3BP2-221ENST00000511747 NEFMP07197 916 aa35.27■■■■□ 3.24
SH3BP2-221ENST00000511747 USP35Q9P2H5 1018 aa35.27■■■■□ 3.24
SH3BP2-221ENST00000511747 ADGRL1O94910 1474 aa35.26■■■■□ 3.23
SH3BP2-221ENST00000511747 BCAR3O75815 825 aa35.25■■■■□ 3.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.24■■■■□ 3.23
SH3BP2-221ENST00000511747 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ABCA6Q8N139 1617 aa35.23■■■■□ 3.23
SH3BP2-221ENST00000511747 NGEFQ8N5V2 710 aa35.22■■■■□ 3.23
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM161AQ3B820 660 aa35.22■■■■□ 3.23
SH3BP2-221ENST00000511747 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.21■■■■□ 3.23
SH3BP2-221ENST00000511747 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.21■■■■□ 3.23
SH3BP2-221ENST00000511747 C8orf34Q49A92 452 aa35.19■■■■□ 3.22
SH3BP2-221ENST00000511747 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.17■■■■□ 3.22
SH3BP2-221ENST00000511747 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.14■■■■□ 3.22
SH3BP2-221ENST00000511747 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
SH3BP2-221ENST00000511747 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.14■■■■□ 3.22
SH3BP2-221ENST00000511747 RGS3P49796 1198 aa35.14■■■■□ 3.22
SH3BP2-221ENST00000511747 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
SH3BP2-221ENST00000511747 KIF1BO60333 1816 aa35.14■■■■□ 3.22
SH3BP2-221ENST00000511747 WWC1Q8IX03 1113 aa35.13■■■■□ 3.21
SH3BP2-221ENST00000511747 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
SH3BP2-221ENST00000511747 NOS1P29475 1434 aa35.1■■■■□ 3.21
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.09■■■■□ 3.21
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC4A3P48751 1232 aa35.09■■■■□ 3.21
SH3BP2-221ENST00000511747 MORC1Q86VD1 984 aa35.08■■■■□ 3.21
SH3BP2-221ENST00000511747 PDE3AQ14432 1141 aa35.07■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 IFT172Q9UG01 1749 aa35.07■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.07■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 MROH2AA6NES4 1674 aa35.05■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHDP01880 384 aa35.05■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.05■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.04■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.04■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 ASXL2Q76L83 1435 aa35.03■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.03■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.02■■■■□ 3.2
SH3BP2-221ENST00000511747 NEUROD2Q15784 382 aa35.01■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.99■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.99■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 ADGRB3O60242 1522 aa34.99■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 CANXP27824 592 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 RUNDC1Q96C34 613 aa34.99■■■■□ 3.19
SH3BP2-221ENST00000511747 PANK1Q8TE04 598 aa34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms