RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

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Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 KCNC4Q03721 635 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBVA-201ENST00000498804 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBVA-201ENST00000498804 PHOX2BQ99453 314 aa7.45□□□□□ -1.22
TRBVA-201ENST00000498804 NLRP7Q8WX94 980 aa7.44□□□□□ -1.22
TRBVA-201ENST00000498804 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.44□□□□□ -1.22
TRBVA-201ENST00000498804 A0A0G2JS52 829 aa7.43□□□□□ -1.22
TRBVA-201ENST00000498804 RCCD1A6NED2 376 aa7.42□□□□□ -1.22
TRBVA-201ENST00000498804 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.42□□□□□ -1.22
TRBVA-201ENST00000498804 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.41□□□□□ -1.22
TRBVA-201ENST00000498804 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TRBVA-201ENST00000498804 IL21Q9HBE4 155 aa7.4□□□□□ -1.22
TRBVA-201ENST00000498804 APLP1P51693 650 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.39□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 MTRQ99707 1265 aa7.38□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 MAP2K5Q13163 448 aa7.36□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 ZMYND10O75800 440 aa7.35□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 SULF1Q8IWU6 871 aa7.35□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 CCDC102AQ96A19 550 aa7.35□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.35□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 CFHP08603 1231 aa7.34□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 SLC10A3P09131 477 aa7.34□□□□□ -1.23
TRBVA-201ENST00000498804 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 IRF6O14896 467 aa7.33□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 GGCXP38435 758 aa7.32□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 BARGINQ6ZT62 677 aa7.32□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 ZPR1O75312 459 aa7.31□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 COPS2P61201 443 aa7.31□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 RDH13Q8NBN7 331 aa7.3□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 BCANQ96GW7 911 aa7.3□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 NR1I2O75469 434 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF516Q92618 1163 aa7.29□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.28□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRBVA-201ENST00000498804 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.27□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.26□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 CLCN1P35523 988 aa7.25□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 GCGRP47871 477 aa7.25□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.25□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 ATP6V1AP38606 617 aa7.24□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.24□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 ADH1BP00325 375 aa7.23□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.23□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 TRIM66O15016 1216 aa7.22□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 TLL1O43897 1013 aa7.22□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 CD46P15529 392 aa7.22□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 FUT2Q10981 343 aa7.22□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.22□□□□□ -1.25
TRBVA-201ENST00000498804 AMHR2Q16671 573 aa7.21□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 MORN1Q5T089 497 aa7.21□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.21□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 USP46P62068 366 aa7.2□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 LAPTM4AQ15012 233 aa7.2□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 HLA-CQ95604 372 aa7.2□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 SPSB2Q99619 263 aa7.2□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.2□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.19□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.19□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 RNF223E7ERA6 249 aa7.18□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 KDM4AO75164 1064 aa7.18□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 Q3C1V9 767 aa7.18□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 S1PR4O95977 384 aa7.17□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 MS4A1P11836 297 aa7.17□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 AK7Q96M32 723 aa7.17□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.16□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 GUCA2AQ02747 115 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 PDE4DQ08499 809 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 THAP11Q96EK4 314 aa7.15□□□□□ -1.26
TRBVA-201ENST00000498804 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 SLC19A1P41440 591 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 MSS51Q4VC12 460 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.14□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 BRICD5Q6PL45 260 aa7.13□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 HOXA2O43364 376 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.12□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 GFRA3O60609 400 aa7.11□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.11□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.11□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.1□□□□□ -1.27
TRBVA-201ENST00000498804 SPRYD7Q5W111 196 aa7.1□□□□□ -1.27
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