RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490886.5

EXD3-211, Transcript of exonuclease 3'-5' domain containing 3, humanhuman

TSL 5

Gene EXD3, Length 1,123 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD3-211ENST00000490886 TRIM52Q96A61 297 aa28.5■■■□□ 2.15
EXD3-211ENST00000490886 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.5■■■□□ 2.15
EXD3-211ENST00000490886 TOM1O60784 492 aa28.49■■■□□ 2.15
EXD3-211ENST00000490886 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
EXD3-211ENST00000490886 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.15
EXD3-211ENST00000490886 BCANQ96GW7 911 aa28.47■■■□□ 2.15
EXD3-211ENST00000490886 TRPM2O94759 1503 aa28.44■■■□□ 2.14
EXD3-211ENST00000490886 KCNA6P17658 529 aa28.44■■■□□ 2.14
EXD3-211ENST00000490886 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
EXD3-211ENST00000490886 CLTCL1P53675 1640 aa28.41■■■□□ 2.14
EXD3-211ENST00000490886 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
EXD3-211ENST00000490886 ALKQ9UM73 1620 aa28.4■■■□□ 2.14
EXD3-211ENST00000490886 PIP4K2BP78356 416 aa28.4■■■□□ 2.14
EXD3-211ENST00000490886 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
EXD3-211ENST00000490886 NWD1Q149M9 1564 aa28.4■■■□□ 2.14
EXD3-211ENST00000490886 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
EXD3-211ENST00000490886 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
EXD3-211ENST00000490886 TBX22Q9Y458 520 aa28.37■■■□□ 2.13
EXD3-211ENST00000490886 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
EXD3-211ENST00000490886 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.35■■■□□ 2.13
EXD3-211ENST00000490886 DIP2AQ14689 1571 aa28.35■■■□□ 2.13
EXD3-211ENST00000490886 TMEM94Q12767 1356 aa28.35■■■□□ 2.13
EXD3-211ENST00000490886 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
EXD3-211ENST00000490886 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
EXD3-211ENST00000490886 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
EXD3-211ENST00000490886 KIF1BO60333 1816 aa28.33■■■□□ 2.13
EXD3-211ENST00000490886 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.29■■■□□ 2.12
EXD3-211ENST00000490886 PIK3R4Q99570 1358 aa28.28■■■□□ 2.12
EXD3-211ENST00000490886 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
EXD3-211ENST00000490886 HSPA1LP34931 641 aa28.28■■■□□ 2.12
EXD3-211ENST00000490886 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.28■■■□□ 2.12
EXD3-211ENST00000490886 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.27■■■□□ 2.12
EXD3-211ENST00000490886 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.26■■■□□ 2.11
EXD3-211ENST00000490886 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.25■■■□□ 2.11
EXD3-211ENST00000490886 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.25■■■□□ 2.11
EXD3-211ENST00000490886 FOXD1Q16676 465 aa28.25■■■□□ 2.11
EXD3-211ENST00000490886 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
EXD3-211ENST00000490886 MSH6P52701 1360 aa28.19■■■□□ 2.1
EXD3-211ENST00000490886 PTPRUQ92729 1446 aa28.18■■■□□ 2.1
EXD3-211ENST00000490886 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.18■■■□□ 2.1
EXD3-211ENST00000490886 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.18■■■□□ 2.1
EXD3-211ENST00000490886 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.18■■■□□ 2.1
EXD3-211ENST00000490886 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.18■■■□□ 2.1
EXD3-211ENST00000490886 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.17■■■□□ 2.1
EXD3-211ENST00000490886 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
EXD3-211ENST00000490886 ILDR2Q71H61 639 aa28.14■■■□□ 2.1
EXD3-211ENST00000490886 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.14■■■□□ 2.1
EXD3-211ENST00000490886 METP08581 1390 aa28.13■■■□□ 2.09
EXD3-211ENST00000490886 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
EXD3-211ENST00000490886 PPLO60437 1756 aa28.12■■■□□ 2.09
EXD3-211ENST00000490886 C14orf37Q86TY3 774 aa28.09■■■□□ 2.09
EXD3-211ENST00000490886 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.09■■■□□ 2.09
EXD3-211ENST00000490886 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.07■■■□□ 2.08
EXD3-211ENST00000490886 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.06■■■□□ 2.08
EXD3-211ENST00000490886 SLAIN2Q9P270 581 aa28.06■■■□□ 2.08
EXD3-211ENST00000490886 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
EXD3-211ENST00000490886 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
EXD3-211ENST00000490886 RGL3Q3MIN7 710 aa28.04■■■□□ 2.08
EXD3-211ENST00000490886 HRCP23327 699 aa28.03■■■□□ 2.08
EXD3-211ENST00000490886 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.02■■■□□ 2.08
EXD3-211ENST00000490886 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
EXD3-211ENST00000490886 IFT172Q9UG01 1749 aa28.01■■■□□ 2.07
EXD3-211ENST00000490886 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28■■■□□ 2.07
EXD3-211ENST00000490886 ATF3P18847 181 aa28■■■□□ 2.07
EXD3-211ENST00000490886 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.98■■■□□ 2.07
EXD3-211ENST00000490886 DCCP43146 1447 aa27.98■■■□□ 2.07
EXD3-211ENST00000490886 PTCH1Q13635 1447 aa27.95■■■□□ 2.07
EXD3-211ENST00000490886 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.94■■■□□ 2.06
EXD3-211ENST00000490886 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.92■■■□□ 2.06
EXD3-211ENST00000490886 PHLPP1O60346 1717 aa27.9■■■□□ 2.06
EXD3-211ENST00000490886 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.9■■■□□ 2.06
EXD3-211ENST00000490886 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.9■■■□□ 2.06
EXD3-211ENST00000490886 PIK3C2GO75747 1445 aa27.9■■■□□ 2.06
EXD3-211ENST00000490886 SOCS7O14512 581 aa27.87■■■□□ 2.05
EXD3-211ENST00000490886 MST1RQ04912 1400 aa27.86■■■□□ 2.05
EXD3-211ENST00000490886 MYOM2P54296 1465 aa27.85■■■□□ 2.05
EXD3-211ENST00000490886 BRINP3Q76B58 766 aa27.84■■■□□ 2.05
EXD3-211ENST00000490886 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
EXD3-211ENST00000490886 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.83■■■□□ 2.05
EXD3-211ENST00000490886 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
EXD3-211ENST00000490886 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.82■■■□□ 2.04
EXD3-211ENST00000490886 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
EXD3-211ENST00000490886 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
EXD3-211ENST00000490886 TECPR2O15040 1411 aa27.81■■■□□ 2.04
EXD3-211ENST00000490886 JCADQ9P266 1359 aa27.79■■■□□ 2.04
EXD3-211ENST00000490886 ABCC11Q96J66 1382 aa27.78■■■□□ 2.04
EXD3-211ENST00000490886 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.78■■■□□ 2.04
EXD3-211ENST00000490886 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
EXD3-211ENST00000490886 STK26Q9P289 416 aa27.78■■■□□ 2.04
EXD3-211ENST00000490886 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.78■■■□□ 2.04
EXD3-211ENST00000490886 LAMC1P11047 1609 aa27.78■■■□□ 2.04
EXD3-211ENST00000490886 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
EXD3-211ENST00000490886 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.75■■■□□ 2.03
EXD3-211ENST00000490886 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.74■■■□□ 2.03
EXD3-211ENST00000490886 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.73■■■□□ 2.03
EXD3-211ENST00000490886 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.71■■■□□ 2.03
EXD3-211ENST00000490886 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.71■■■□□ 2.03
EXD3-211ENST00000490886 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
EXD3-211ENST00000490886 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.69■■■□□ 2.02
EXD3-211ENST00000490886 STAC3Q96MF2 364 aa27.69■■■□□ 2.02
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