RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.36■□□□□ 0.85
HPS1-209ENST00000470095 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.36■□□□□ 0.85
HPS1-209ENST00000470095 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HPS1-209ENST00000470095 STAC3Q96MF2 364 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS1-209ENST00000470095 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HPS1-209ENST00000470095 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS1-209ENST00000470095 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS1-209ENST00000470095 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS1-209ENST00000470095 ZFYVE9O95405 1425 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS1-209ENST00000470095 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-209ENST00000470095 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-209ENST00000470095 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-209ENST00000470095 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-209ENST00000470095 PIK3C2GO75747 1445 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-209ENST00000470095 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-209ENST00000470095 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-209ENST00000470095 SLIT1O75093 1534 aa20.27■□□□□ 0.83
HPS1-209ENST00000470095 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-209ENST00000470095 LAMC1P11047 1609 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-209ENST00000470095 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HPS1-209ENST00000470095 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HPS1-209ENST00000470095 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HPS1-209ENST00000470095 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-209ENST00000470095 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-209ENST00000470095 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-209ENST00000470095 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 ADGRB1O14514 1584 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 IQGAP1P46940 1657 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 ALKQ9UM73 1620 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 LTKP29376 864 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 USP47Q96K76 1375 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HPS1-209ENST00000470095 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.12■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 EID1Q9Y6B2 187 aa20.11■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 MED14O60244 1454 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HPS1-209ENST00000470095 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS1-209ENST00000470095 DIP2AQ14689 1571 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS1-209ENST00000470095 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HPS1-209ENST00000470095 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.05■□□□□ 0.8
HPS1-209ENST00000470095 METP08581 1390 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-209ENST00000470095 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HPS1-209ENST00000470095 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.02■□□□□ 0.8
HPS1-209ENST00000470095 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.02■□□□□ 0.8
HPS1-209ENST00000470095 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 BCANQ96GW7 911 aa20■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 DLC1Q96QB1 1528 aa20■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 TBX22Q9Y458 520 aa19.99■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 QRICH2Q9H0J4 1663 aa19.98■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 HSPA2P54652 639 aa19.98■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.98■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 TESK2Q96S53 571 aa19.98■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.98■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 TECPR2O15040 1411 aa19.98■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa19.98■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 CPS1P31327 1500 aa19.97■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 ABCC11Q96J66 1382 aa19.97■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 PTPRUQ92729 1446 aa19.97■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
HPS1-209ENST00000470095 STRCQ7RTU9 1775 aa19.95■□□□□ 0.78
HPS1-209ENST00000470095 STK26Q9P289 416 aa19.95■□□□□ 0.78
HPS1-209ENST00000470095 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa19.95■□□□□ 0.78
HPS1-209ENST00000470095 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
HPS1-209ENST00000470095 PIK3R4Q99570 1358 aa19.94■□□□□ 0.78
HPS1-209ENST00000470095 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.93■□□□□ 0.78
HPS1-209ENST00000470095 CCDC7Q96M83 1385 aa19.93■□□□□ 0.78
HPS1-209ENST00000470095 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
HPS1-209ENST00000470095 DISP3Q9P2K9 1392 aa19.92■□□□□ 0.78
HPS1-209ENST00000470095 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.91■□□□□ 0.78
HPS1-209ENST00000470095 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.9■□□□□ 0.78
HPS1-209ENST00000470095 PTCH1Q13635 1447 aa19.89■□□□□ 0.77
HPS1-209ENST00000470095 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.89■□□□□ 0.77
HPS1-209ENST00000470095 NWD1Q149M9 1564 aa19.88■□□□□ 0.77
HPS1-209ENST00000470095 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.88■□□□□ 0.77
HPS1-209ENST00000470095 SIRT1Q96EB6 747 aa19.88■□□□□ 0.77
HPS1-209ENST00000470095 PRAM1Q96QH2 718 aa19.88■□□□□ 0.77
HPS1-209ENST00000470095 TULP4Q9NRJ4 1543 aa19.87■□□□□ 0.77
HPS1-209ENST00000470095 TMF1P82094 1093 aa19.85■□□□□ 0.77
HPS1-209ENST00000470095 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.85■□□□□ 0.77
HPS1-209ENST00000470095 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.84■□□□□ 0.77
HPS1-209ENST00000470095 POGKQ9P215 609 aa19.84■□□□□ 0.77
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