RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-208ENST00000462602 EID1Q9Y6B2 187 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFYVE9O95405 1425 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 MYOM2P54296 1465 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 SLIT1O75093 1534 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 LTKP29376 864 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 PPLO60437 1756 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 IFT172Q9UG01 1749 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 BCANQ96GW7 911 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 PIK3C2GO75747 1445 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 HSPA2P54652 639 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 MED14O60244 1454 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 RALGAPBQ86X10 1494 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 TBX22Q9Y458 520 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 GPRASP1Q5JY77 1395 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 LAMC1P11047 1609 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 ALKQ9UM73 1620 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 DIP2AQ14689 1571 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 PIK3R4Q99570 1358 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 METP08581 1390 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 IQGAP1P46940 1657 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRB1O14514 1584 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCC11Q96J66 1382 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 USP47Q96K76 1375 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 STK26Q9P289 416 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 SIRT1Q96EB6 747 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 STRCQ7RTU9 1775 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC24A1O60721 1099 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNA6P17658 529 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-208ENST00000462602 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 POGKQ9P215 609 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TECPR2O15040 1411 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPRUQ92729 1446 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 DLC1Q96QB1 1528 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PRAM1Q96QH2 718 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PTCH1Q13635 1447 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ROBO2Q9HCK4 1378 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CPS1P31327 1500 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 NWD1Q149M9 1564 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TMF1P82094 1093 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 TESK2Q96S53 571 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 CDCA8Q53HL2 280 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms